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flyaway7585

金虫 (正式写手)

[求助] 求助用dnastar作序列同源性比对

求助用dnastar作序列同源性比对时是用的7个部分中的哪一个？具体如何操作？谢谢!
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1楼 2012-12-25 17:08:47
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回帖置顶 ( 共有1个 )

weiyasong

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
flyaway7585: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 非常感谢！还问个问题，如何把NCBI的序列保存成FASTA格式？MegA中输入的序列要这个格式，或者有其它方法将序列输入到MegA中，因为初学，还请指教！ 2012-12-26 11:29:45
小丹木木: 金币+3, MolEPI+1, 鼓励热心应助 2012-12-26 13:50:27
用MegAlign软件，把所有的序列在软件里打开后，然后点Align里的By Clustal W，进行分析，然后再点View里的Sequence Distances然后就可以了！可以试试，不行的话再联系我，
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2楼2012-12-25 22:31:55
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普通回帖

weiyasong

木虫 (著名写手)
在NCBI的序列网页界面的序列标题有上方有个send to，点击选择File,会拉出来个Format,从里面选择FASTA，然后点击Create File就可以了，你试试。
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3楼2012-12-26 13:26:24
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weiyasong

木虫 (著名写手)
在或者从NCBI里面复制序列，保存到txt文档里，然后把txt格式改成FASTA格式也可以，但是要在该格式前要修改好txt文档，因为只有序列，FASTA不识别，需要在序列前加个>（大于号符号）才可以，>后面可以加上序列的名字什么的，可以试试！
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flyaway7585
4楼2012-12-26 13:30:18
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flyaway7585

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by weiyasong at 2012-12-26 13:30:18
在或者从NCBI里面复制序列，保存到txt文档里，然后把txt格式改成FASTA格式也可以，但是要在该格式前要修改好txt文档，因为只有序列，FASTA不识别，需要在序列前加个>（大于号符号）才可以，>后面可以加上序列 ...

好的，非常感谢！
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5楼2012-12-26 15:25:10
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learningying

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by weiyasong at 2012-12-25 22:31:55
用MegAlign软件，把所有的序列在软件里打开后，然后点Align里的By Clustal W，进行分析，然后再点View里的Sequence Distances然后就可以了！可以试试，不行的话再联系我，

您好 我在网上下载DNAstar 却下载了一个seqbuilder，我想进行序列分析，怎么弄呢？谢谢
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加油，天道酬勤
6楼2014-01-08 22:30:46
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陈宏彬

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by weiyasong at 2012-12-25 22:31:55
用MegAlign软件，把所有的序列在软件里打开后，然后点Align里的By Clustal W，进行分析，然后再点View里的Sequence Distances然后就可以了！可以试试，不行的话再联系我，

得出的是Sequence Distances。那同源性怎么得出？是不是1-遗传距离值乘以100%？
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7楼2016-01-28 10:33:03
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