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flyaway7585

金虫 (正式写手)

[求助] 求助用dnastar作序列同源性比对

求助用dnastar作序列同源性比对时是用的7个部分中的哪一个?具体如何操作?谢谢!
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陈宏彬

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by weiyasong at 2012-12-25 22:31:55
用MegAlign软件,把所有的序列在软件里打开后,然后点Align里的By Clustal W,进行分析,然后再点View里的Sequence Distances然后就可以了!可以试试,不行的话再联系我,

得出的是Sequence Distances。那同源性怎么得出?是不是1-遗传距离值乘以100%?
7楼2016-01-28 10:33:03
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weiyasong

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
flyaway7585: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 非常感谢!还问个问题,如何把NCBI的序列保存成FASTA格式?MegA中输入的序列要这个格式,或者有其它方法将序列输入到MegA中,因为初学,还请指教! 2012-12-26 11:29:45
小丹木木: 金币+3, MolEPI+1, 鼓励热心应助 2012-12-26 13:50:27
用MegAlign软件,把所有的序列在软件里打开后,然后点Align里的By Clustal W,进行分析,然后再点View里的Sequence Distances然后就可以了!可以试试,不行的话再联系我,
2楼2012-12-25 22:31:55
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weiyasong

木虫 (著名写手)

在NCBI的序列网页界面的序列标题有上方有个send to,点击选择File,会拉出来个Format,从里面选择FASTA,然后点击Create File就可以了,你试试。
3楼2012-12-26 13:26:24
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weiyasong

木虫 (著名写手)

在或者从NCBI里面复制序列,保存到txt文档里,然后把txt格式改成FASTA格式也可以,但是要在该格式前要修改好txt文档,因为只有序列,FASTA不识别,需要在序列前加个>(大于号符号)才可以,>后面可以加上序列的名字什么的,可以试试!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-12-26 13:30:18
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