| 查看: 2217 | 回复: 4 | |||
[求助]
ITS1/4序列进行blast同源比对问题
|
|
刚接触菌种鉴定，有些问题搞不懂，请教各位大牛： 用ITS1/4引物扩增真菌DNA所得产物测序，获得一个序列，在ncbi上进行blast后，出来很多相似度高的菌株，那么我要比对的话，只能选择同样是由ITS1/4扩增出来的序列进行同源性比对吗？如果没有ITS1/ITS4扩增的序列呢？怎么办？ 要发菌种鉴定的文章是否一定要有登录号呢？ 万分感谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
职称评审没过，求安慰
已经有49人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
-
垃圾破二本职称评审标准
已经有17人回复
-
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿
已经有22人回复
-
EST投稿状态问题
已经有7人回复
-
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有4人回复
-
三无产品还有机会吗
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 转录组测序后的序列在NCBI上BLAST后遇到的一些问题，求解答
已经有5人回复
- PCR扩增出来的条带,与预计大小一致,测序居然什么都不是????
已经有4人回复
- 16S rDNA 鉴定细菌的方法及其注意事项
已经有236人回复
- 急！NCBI的使用和进化树构建求助
已经有4人回复
- 真菌18S，28S，ITS区段。
已经有14人回复
- 急求序列结构分析
已经有9人回复
- 构建进化树过程中，我如何把我的菌的序列 和我 选择同源的序列 编辑在一起进行比对？
已经有5人回复
- 菌种鉴定的费用悬殊？鉴定内容却…？请教各位前辈啊。
已经有26人回复
- DNA条形码能用来分析种内的遗传变异、遗传多样性吗？
已经有11人回复
- 关于生物进化发育树之类的分析
已经有9人回复
- 菌株16S rDNA同源性分析方法！！
已经有5人回复
- 做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法！！
已经有18人回复
- 关于进化树序列选择的问题
已经有4人回复
- 【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
已经有18人回复
冼亮淀粉酶
专家顾问 (知名作家)
生物大分子降解酶
-
专家经验: +248 - MicEPI: 114
- 应助: 257 (大学生)
- 贵宾: 0.272
- 金币: 19282.6
- 散金: 1704
- 红花: 121
- 帖子: 6565
- 在线: 2766.2小时
- 虫号: 856414
- 注册: 2009-09-25
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 微生物
2楼2013-11-22 20:04:09
肥猫p
木虫 (正式写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 2763.1
- 散金: 145
- 红花: 10
- 帖子: 340
- 在线: 189.3小时
- 虫号: 1709733
- 注册: 2012-03-22
- 专业: 微生物资源与分类学
3楼2013-11-22 21:45:25
4楼2013-11-23 23:17:20
冼亮淀粉酶
专家顾问 (知名作家)
生物大分子降解酶
-
专家经验: +248 - MicEPI: 114
- 应助: 257 (大学生)
- 贵宾: 0.272
- 金币: 19282.6
- 散金: 1704
- 红花: 121
- 帖子: 6565
- 在线: 2766.2小时
- 虫号: 856414
- 注册: 2009-09-25
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 微生物
5楼2013-11-23 23:23:39