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ITS1/4序列进行blast同源比对问题
刚接触菌种鉴定,有些问题搞不懂,请教各位大牛:
用ITS1/4引物扩增真菌DNA所得产物测序,获得一个序列,在ncbi上进行blast后,出来很多相似度高的菌株,那么我要比对的话,只能选择同样是由ITS1/4扩增出来的序列进行同源性比对吗?如果没有ITS1/ITS4扩增的序列呢?怎么办?
要发菌种鉴定的文章是否一定要有登录号呢?
万分感谢! |
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