| 查看: 1900 | 回复: 5 | ||
[求助]
构建进化树过程中，我如何把我的菌的序列 和我 选择同源的序列 编辑在一起进行比对？
|
| 我的细菌序列在 3-4.txt文件里，也已经处理成FASTA格式的了，另外我选取的同源比对的基因序列，也处理好了，现在遇到的问题是怎么把我的菌和这些选取的进行同源比对，然后再构建进化树呢？我的3-4插不进去啊……不知道大家看懂没，求高手指导……如何构建这组进化树呢……搞不懂，我都要疯了…… |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 3-4.txt
- 附件 2 : sequence.meg
- 附件 3 : sequence.fasta
2012-05-23 17:17:07, 1.63 K
2012-05-23 17:17:16, 32.51 K
2012-05-23 17:17:23, 31.84 K
» 猜你喜欢
我面上完蛋了
已经有11人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有8人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有3人回复
-
明天应该可查了！？
已经有5人回复
-
如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》
已经有7人回复
-
没有任何消息-是不是就凉了
已经有8人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
人气不行了
已经有10人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有24人回复
-
filecode，4个jtjc了
已经有17人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- offer选择，时间紧迫啊
已经有19人回复
- 【求助】用cDNA的ORF序列以基因组DNA为模板 做PCR 为何P不出其对应的基因组序列?
已经有8人回复
- 要做抗体，如何选择用哪段序列来表达蛋白？
已经有5人回复
- 细菌多样性，构建系统进化树中如何选择outgroup？急！！！！！！！
已经有15人回复
- 请问如何将进化树中的菌种名称显示出来？
已经有20人回复
- 寻求把细菌的16s rDNA序列提交到Genbank，申请accession number 的专家-谢谢！
已经有3人回复
- 蛋白进化树构建的序列选择原则
已经有6人回复
- Heeelp: Mega4建进化树，用的是核酸推导出的氨基酸序列,有两选项不知道如何选
已经有4人回复
- 同源性与进化树的矛盾
已经有24人回复
- 【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？
已经有7人回复
- 【求助/交流】构建进化树前序列的处理问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】引物设计的 序列选择问题
已经有9人回复
- 【求助/交流】为何测序结果出来的是大肠杆菌的序列啊?
已经有6人回复
- 【求助/交流】怎么在ncbi上查询细菌的16s rDNA的全序列？
已经有3人回复
ben1147
木虫 (正式写手)
- 应助: 18 (小学生)
- 贵宾: 0.003
- 金币: 5847.6
- 红花: 6
- 帖子: 952
- 在线: 116.9小时
- 虫号: 709538
- 注册: 2009-02-26
- 专业: 微生物生理与生物化学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
| 序列都放进一个fasta，用clustal对齐，用mega转成meg格式再进行聚类分析 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
tiger86gyc2楼2012-05-23 18:34:25
3楼2012-05-24 11:06:53
4楼2012-05-24 11:08:48
ben1147
木虫 (正式写手)
- 应助: 18 (小学生)
- 贵宾: 0.003
- 金币: 5847.6
- 红花: 6
- 帖子: 952
- 在线: 116.9小时
- 虫号: 709538
- 注册: 2009-02-26
- 专业: 微生物生理与生物化学
5楼2012-05-24 16:28:40
gpkyll
木虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3444.9
- 散金: 1326
- 红花: 1
- 帖子: 274
- 在线: 219.4小时
- 虫号: 984935
- 注册: 2010-03-29
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
6楼2012-05-25 09:00:06
20