24小时热门版块排行榜

返回列表

飞扬886

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 400.6
帖子: 87
在线: 76.1小时
虫号: 480207

[交流] 【求助/交流】构建进化树前序列的处理问题

在构建进化树之前，比对好的序列往往需要处理一下，比如去除gaps等，但是不知道通常需要处理到一个什么样的程度比较合适？序列相似性比较低的区域是否也要去除呢，去掉太多序列会不会影响结果。请有经验者指教，谢谢！

回复此楼

» 猜你喜欢

职称评审没过，求安慰已经有49人回复
26申博自荐已经有3人回复
A期刊撤稿已经有4人回复
垃圾破二本职称评审标准已经有17人回复
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿已经有22人回复
EST投稿状态问题已经有7人回复
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦已经有4人回复
三无产品还有机会吗已经有6人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

关于系统进化树构建方法的求助已经有8人回复
细菌多样性，构建系统进化树中如何选择outgroup？急！！！！！！！已经有15人回复
请教：超家族基因扩增后确定类别及构建进化树已经有3人回复
蛋白进化树构建的序列选择原则已经有6人回复
构建一棵微生物进化树已经有10人回复
【原创】原创之七：【图文】系统进化树的构建及编辑【已搜索无重复】已经有377人回复
【求助】请教生物信息学方面的专家，一个进化树构建的问题？已经有10人回复
【求助/交流】系统进化树的构建已经有12人回复
【求助/交流】用MEGA4.0做进化树的问题已经有14人回复
【求助/交流】有关MEGA构建进化树已经有9人回复
【求助/交流】16s 构建进化树已经有8人回复
【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了已经有6人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2011-02-24 17:07:17

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

秋电工

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 86.6
帖子: 56
在线: 13.3小时
虫号: 836091

★
飞扬886(金币+5):谢谢参与

引用回帖:

Originally posted by 飞扬886 at 2011-02-24 17:07:17:
在构建进化树之前，比对好的序列往往需要处理一下，比如去除gaps等，但是不知道通常需要处理到一个什么样的程度比较合适？序列相似性比较低的区域是否也要去除呢，去掉太多序列会不会影响结果。请有经验者指教，谢 ...

mega4.0及以后更新版本的全歼中都嵌合了clustal，建树前，进行clustal一下。我这求了份说明书，也是初学，你若有需要我发你一份