应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
71/1返回列表
查看: 1879  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

finding1371

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了 已有4人参与

构建进化树，到底是基于核酸序列还是氨基酸序列，还是两者都可以用来建树呢，
比如这句话Phylogenetic tree for the strains of Acinetobacter based on the amino acid sequences of gvrB products by the neighbor-joining method.似乎是用氨基酸序列来建树吗。如果用核酸序列建树有何差异呢，关注理论讲解。真诚谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-13 19:29:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
finding1371(金币+10):谢谢你呀，呵呵 2010-08-13 19:50:45
我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……
赞一下 回复此楼
2楼2010-08-13 19:41:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-08-13 19:41:31:
我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……

我想建的进化树是曲霉属间的，他们的氨基酸序列同源性在70%-99%不等，核酸同源性60%-90%左右，不知道是在核酸水平上建树还是在氨基酸水平上建树呢，顺便问你一下了，就是我用MEG4.0建树，树枝上怎么没有数字显示啊，bioeidt 可以建树吗，谢谢你了，呵呵

[ Last edited by finding1371 on 2010-8-13 at 19:57 ]
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-13 19:50:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+3):鼓励一下！ 2010-08-13 20:27:09
你有没有选bootstrap检验啊？数字一般是表示进行1000次建树后，多少次得到这样的结果，我个人认为，你都可以建下，看哪个结果更能说明问题，还有就是看你要发表的杂志的需要了……
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-08-13 20:19:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-08-13 20:19:31:
你有没有选bootstrap检验啊？数字一般是表示进行1000次建树后，多少次得到这样的结果，我个人认为，你都可以建下，看哪个结果更能说明问题，还有就是看你要发表的杂志的需要了……

哦，好的，明白一点了，呵呵，再次谢谢你！
赞一下 回复此楼
5楼2010-08-13 20:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

欣晴5832

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
现在已经有MEGA5了，你可以下载，那个更好一点，支持ML树，bootstrap检验一般都是要的，可以设定一下。另外，建树时还要选一下模型，根据自己的序列选择合适的，结果会更好一些。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-08-14 09:27:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jolly_2006

一般用氨基酸序列建树，可信度跟高
赞一下 回复此楼
7楼2010-08-14 20:02:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 finding1371 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 20:07 by 啵啵啵0119
[考研] 329求调剂 +17 miaodesi 2026-04-02 20/1000 2026-04-05 18:33 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿211生物学280分 求调剂 +4 李rien 2026-04-05 4/200 2026-04-05 18:01 by kk112233
[考研] 一志愿上海海洋大学083200食品学硕，求调剂，接受其他专业083200 +4 what张 2026-04-04 5/250 2026-04-05 14:07 by chw1980_0
[考研] 材料科学与工程调剂 +19 深V宿舍吧 2026-03-30 20/1000 2026-04-04 22:13 by hemengdong
[考研] 282电子信息0854专硕调剂 +4 202451007219 2026-04-02 6/300 2026-04-04 21:55 by laoshidan
[考研] 341求调剂 +3 洛多罗 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:36 by 智能智慧
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-04 20:37 by 蓝云思雨
[考研] 277求调剂 +4 12A3 2026-04-02 5/250 2026-04-04 20:28 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂：085600材料与化工，考材科基，总分319 +21 678lucky 2026-03-31 26/1300 2026-04-04 16:22 by dongzh2009
[考研] 22408，264求调剂 +3 ywh729 2026-04-03 4/200 2026-04-04 11:04 by ywh729
[考研] 338求调剂 +4 zzz，，r 2026-04-03 4/200 2026-04-03 16:39 by lijunpoly
[考研] 266分，求材料相关专业调剂 +13 哇呼哼呼哼 2026-03-30 15/750 2026-04-03 15:24 by arrow8852
[考研] 0705理学294求调剂 +3 成果成果cg5 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:04 by simons1972
[考研] 建环，能源，土木老师路过看一看！！！ +5 嘿嘿uu 2026-04-01 5/250 2026-04-03 11:47 by znian
[考研] 0805求调剂 +8 是水分 2026-03-31 8/400 2026-04-02 10:46 by guanxin1001
[考研] 省双一流重点一本大学招收调剂 +4 wwwwffffff 2026-03-31 7/350 2026-04-01 15:23 by wwwwffffff
[考研] 311求调剂 +10 李芷新1 2026-03-31 10/500 2026-04-01 14:38 by chenqifeng666
[考研] 339求调剂 +5 zjjkt 2026-03-31 5/250 2026-04-01 09:18 by JourneyLucky
[考研] 物理学调剂 +4 小羊36 2026-03-30 4/200 2026-03-31 16:16 by lishahe
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭