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finding1371

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[交流] 【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了已有4人参与

构建进化树，到底是基于核酸序列还是氨基酸序列，还是两者都可以用来建树呢，
比如这句话Phylogenetic tree for the strains of Acinetobacter based on the amino acid sequences of gvrB products by the neighbor-joining method.似乎是用氨基酸序列来建树吗。如果用核酸序列建树有何差异呢，关注理论讲解。真诚谢谢！

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1楼 2010-08-13 19:29:12

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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

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finding1371(金币+10):谢谢你呀，呵呵 2010-08-13 19:50:45

我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……

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2楼2010-08-13 19:41:31

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finding1371

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引用回帖:

Originally posted by xp198766 at 2010-08-13 19:41:31:
我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……

我想建的进化树是曲霉属间的，他们的氨基酸序列同源性在70%-99%不等，核酸同源性60%-90%左右，不知道是在核酸水平上建树还是在氨基酸水平上建树呢，顺便问你一下了，就是我用MEG4.0建树，树枝上怎么没有数字显示啊，bioeidt 可以建树吗，谢谢你了，呵呵

[ Last edited by finding1371 on 2010-8-13 at 19:57 ]

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3楼2010-08-13 19:50:16

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