应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【交流】MEGA构建进化树史上最难的问题求助，必有金币酬谢
91/1返回列表
查看: 3655  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看

bioinfuture

铁虫 (小有名气)

[交流] 【交流】MEGA构建进化树史上最难的问题求助，必有金币酬谢

就是用MEGA生成进化树后，进化树下面的标尺表示什么意思的？他的单位是什么呢？还有根据进化树采用的方法会得到不同的标尺，这些都是什么含义呢？
我认为这是MEGA构建进化树最难理解的问题，我不是学习生物信息专业的，希望有能够知道这方面知识的人告诉我哈。
谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-10 10:02:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

andrewjun15

木虫 (小有名气)
帮忙顶，一直也糊糊涂涂的，
赞一下 回复此楼
2楼2011-04-10 10:40:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bioinfuture

铁虫 (小有名气)

欢迎大家都来讨论呀

希望有志之士能够提供帮助
赞一下 回复此楼
3楼2011-04-10 13:15:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hitliutao

银虫 (小有名气)
这是大家都比较迷惑的问题
赞一下 回复此楼
4楼2011-04-10 14:37:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

看天

木虫 (知名作家)
是进化年大吗
回复此楼
5楼2011-04-10 18:29:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bioinfuture

铁虫 (小有名气)

大家都帮忙顶一下，看看能不能找到答案

快来看呀
回复此楼
6楼2011-04-10 21:20:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

秋电工

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bioinfuture at 2011-04-10 21:20:50:
快来看呀

看来大伙都只有这点水，耐心等高人吧，同样的困惑呀，哎！
赞一下 回复此楼
7楼2011-04-15 20:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

reasonspare

木虫 (著名写手)
silicare(EPI+1): 2011-04-18 18:59:35
引用回帖:
Originally posted by bioinfuture at 2011-04-10 10:02:54:
就是用MEGA生成进化树后，进化树下面的标尺表示什么意思的？他的单位是什么呢？还有根据进化树采用的方法会得到不同的标尺，这些都是什么含义呢？
我认为这是MEGA构建进化树最难理解的问题，我不是学习生物信息专 ...

的确，不同的建树方法会的不同的遗传距离。
通常的建树方法为：Ｎｅｉｂｏｕｇ　Ｊｉｏｎｔ，　ｐａｒａｓｉｏｎ，　Ｍａｘ　Ｌｉｋｅｌｙｈｏｏｄ，　ＵＰＧＭＡ．

此外大家喜欢加入ｂｏｏｓｔｒａｐ　通常为１００，　或者１０００、。


比如你建了一个树
The evolutionary history was inferred using the Neighbor-Joining method。

那么这个树的分支，和分支的长度是有意义的，这分枝的意义通过其长度来表示其遗传速率，突变率，进化率，等等，这些你都可以定义，如果默认的情况下：
with branch lengths in the same units as those of the evolutionary distances used to infer the phylogenetic tree。也就是每一突变单位，等于一个单位的进化距离，等于一个单位的树长。

所以一个树的最主要的参考就是那个标尺，这个标尺也可以进行人文的标定：如　１个单位树长度＝两个突变率，＝０．１％进化率，等等，根据自己试验对象而定，并且一定标注参考文献，否则，就是采用上面的默认情况。
赞一下(6人) 回复此楼
8楼2011-04-16 11:54:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
6323624819楼
2015-06-19 10:48   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 bioinfuture 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 123/6150 2026-08-19 23:44 by stan_et
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +13 kkkl_v 2026-08-19 13/650 2026-08-19 22:37 by 宝贝虫子
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +12 基诺咪客 2026-08-17 16/800 2026-08-19 22:04 by kk 的小木虫
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭