| 查看: 3062 | 回复: 8 | |||
| 本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看 | |||
[交流]
【交流】MEGA构建进化树史上最难的问题求助，必有金币酬谢
|
|||
|
就是用MEGA生成进化树后，进化树下面的标尺表示什么意思的？他的单位是什么呢？还有根据进化树采用的方法会得到不同的标尺，这些都是什么含义呢？ 我认为这是MEGA构建进化树最难理解的问题，我不是学习生物信息专业的，希望有能够知道这方面知识的人告诉我哈。 谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
真诚求助：手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心，有什么渠道能发核心吗
已经有8人回复
-
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有5人回复
-
论文投稿，期刊推荐
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有4人回复
-
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有14人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有5人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有3人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有4人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
没金币求助，菌体在液体培养基中聚集成团絮状
已经有21人回复- 再求助翻译一小小段摘要
已经有2人回复
- 求助翻译一小小段摘要
已经有2人回复
- 关于系统进化树构建方法的求助
已经有8人回复
- 求助：细菌浓度的测量
已经有27人回复
- 【求助】进化树的构建到底有什么意义呢？
已经有12人回复
- 【求助】请教生物信息学方面的专家，一个进化树构建的问题？
已经有10人回复
- 【求助/交流】系统进化树的构建
已经有12人回复
- 【求助/交流】用MEGA4.0做进化树的问题
已经有14人回复
- 【求助/交流】MEGA4做的进化树中怎么显示bootstrap 值
已经有7人回复
- 【求助/交流】有关MEGA构建进化树
已经有9人回复
- 【求助/交流】16s 构建进化树
已经有8人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
双面压敏硅胶胶带
+2/92
-
双一流大学湘潭大学“化工过程模拟与强化”国家地方联合工程研究中心招收各类博士生
+1/87
-
双一流大学-湘潭大学“电化学能源储存与转换”湖南省重点实验室招生电池方向博士生
+1/87
-
硫化物全固态电池的产业化破局：手套箱如何实现全线稳定制造
+1/84
-
华东师范大学 程义云 课题组招2026年博士研究生 - 有机化学、材料化学、高分子合成等
+1/82
-
加拿大/英属哥伦比亚大学曹彦凯课题组招收全奖博士/博后 [机器学习/优化/控制方向]
+1/82
-
招收26年资源与环境领域、生物质生物转化、生物技术等方向博士研究生
+1/79
-
Call for papers，征稿
+1/57
-
南昌大学药学博士招生
+1/40
-
中南大学冶金与环境学院陈伟老师招收环境科学与工程2026年博士生1人
+1/34
-
双一流大学湘潭大学“化工过程模拟与强化”国家地方联合工程研究中心招收各类博士生
+1/32
-
天津医科大学基础医学院张恒课题组博士后招聘
+1/27
-
华北电力大学（北京）（第一性原理计算）博士招生——学博，专博各1人
+2/14
-
长江大学武汉校区诚招工程热物理、油气、电气等新能源博士-2025
+1/10
-
海南大学国家高层次人才团队2026年博士招生
+1/9
-
浙江大学-化工学院刘平伟课题组-二维材料/功能聚合物开发
+1/6
-
诚招博士后及研究人员
+1/5
-
三峡集团科研院海上风电研究项目实习生招聘公告
+1/2
-
东莞理工学院-大连化物所联合招聘光催化方向博士后2名（年薪48W）
+1/2
-
上海交通大学章晔课题组诚聘博士后（半导体、纳米光学、超材料方向）
+1/1
2楼2011-04-10 10:40:05
3楼2011-04-10 13:15:21
4楼2011-04-10 14:37:59
5楼2011-04-10 18:29:41
6楼2011-04-10 21:20:50
7楼2011-04-15 20:42:51
silicare(EPI+1): 2011-04-18 18:59:35
|
的确，不同的建树方法会的不同的遗传距离。 通常的建树方法为：Ｎｅｉｂｏｕｇ Ｊｉｏｎｔ， ｐａｒａｓｉｏｎ， Ｍａｘ Ｌｉｋｅｌｙｈｏｏｄ， ＵＰＧＭＡ． 此外大家喜欢加入ｂｏｏｓｔｒａｐ 通常为１００， 或者１０００、。 比如你建了一个树 The evolutionary history was inferred using the Neighbor-Joining method。 那么这个树的分支，和分支的长度是有意义的，这分枝的意义通过其长度来表示其遗传速率，突变率，进化率，等等，这些你都可以定义，如果默认的情况下： with branch lengths in the same units as those of the evolutionary distances used to infer the phylogenetic tree。也就是每一突变单位，等于一个单位的进化距离，等于一个单位的树长。 所以一个树的最主要的参考就是那个标尺，这个标尺也可以进行人文的标定：如 １个单位树长度＝两个突变率，＝０．１％进化率，等等，根据自己试验对象而定，并且一定标注参考文献，否则，就是采用上面的默认情况。 |
8楼2011-04-16 11:54:32
简单回复
2015-06-19 10:48
回复
