| 查看: 3250 | 回复: 8 | |||
| 本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看 | |||
[交流]
【交流】MEGA构建进化树史上最难的问题求助，必有金币酬谢
|
|||
|
就是用MEGA生成进化树后，进化树下面的标尺表示什么意思的？他的单位是什么呢？还有根据进化树采用的方法会得到不同的标尺，这些都是什么含义呢？ 我认为这是MEGA构建进化树最难理解的问题，我不是学习生物信息专业的，希望有能够知道这方面知识的人告诉我哈。 谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
网上报道青年教师午睡中猝死、熬夜猝死的越来越多，主要哪些原因引起的？
已经有3人回复
-
为什么中国大学工科教授们水了那么多所谓的顶会顶刊，但还是做不出宇树机器人？
已经有10人回复
-
版面费该交吗
已经有12人回复
-
面上可以超过30页吧？
已经有5人回复
-
体制内长辈说体制内绝大部分一辈子在底层，如同你们一样大部分普通教师忙且收入低
已经有13人回复
-
“人文社科而论，许多学术研究还没有达到民国时期的水平”
已经有5人回复
-
什么是人一生最重要的？
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 没金币求助，菌体在液体培养基中聚集成团絮状
已经有21人回复
- 再求助翻译一小小段摘要
已经有2人回复
- 求助翻译一小小段摘要
已经有2人回复
- 关于系统进化树构建方法的求助
已经有8人回复
- 求助：细菌浓度的测量
已经有27人回复
- 【求助】进化树的构建到底有什么意义呢？
已经有12人回复
- 【求助】请教生物信息学方面的专家，一个进化树构建的问题？
已经有10人回复
- 【求助/交流】系统进化树的构建
已经有12人回复
- 【求助/交流】用MEGA4.0做进化树的问题
已经有14人回复
- 【求助/交流】MEGA4做的进化树中怎么显示bootstrap 值
已经有7人回复
- 【求助/交流】有关MEGA构建进化树
已经有9人回复
- 【求助/交流】16s 构建进化树
已经有8人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
农药产品分析实验人员招聘
+5/450
-
南通大学生物医药方向国家级人才团队招聘教师
+3/92
-
招收桥梁工程方向博士研究生！
+3/89
-
上海交通大学叶天南课题组招聘2026级博士研究生
+1/85
-
上海交通大学叶天南课题组招聘2026级博士研究生
+1/81
-
广工-董华锋教授团队招收博士生（1学博-0-1专博）
+1/77
-
博洛尼亚大学能源材料课题组2个博后位置招聘（PNRR & MSCA）
+1/73
-
澳门理工大学人工智能智慧康养方向26 年9月入学博士招生有奖学金
+1/40
-
南通大学生物医药方向国家级人才团队招收“申请-考核”制博士研究生20260222
+2/36
-
211大学【2026学博】补招
+1/35
-
澳门理工大学人工智能智慧康养2026 年9月入学 博士招生有奖学金
+1/34
-
北京某研究院结构生物学相关专业申请考核制博士招生（春季）
+1/14
-
香港城市大学招聘博士后 (有机合成/催化/流动化学)
+1/10
-
新加坡南洋理工大学- 光电/ 智能传感/ 脑机接口方向 博士后
+1/7
-
南昌大学资源与环境学院刘进教授团队招收2026硕博研究生
+1/5
-
招生帖
+1/5
-
国自然B0706药物化学生物学，需要什么样的文章才能中
+1/4
-
内江师范学院能源转化与储能实验室诚聘博士1-2人
+1/3
-
天津医科大学基础医学院张恒课题组博士后招聘
+1/3
-
武汉纺织大学全国重点实验室陈嵘教授团队招收硕士研究生
+1/2
2楼2011-04-10 10:40:05
3楼2011-04-10 13:15:21
4楼2011-04-10 14:37:59
5楼2011-04-10 18:29:41
6楼2011-04-10 21:20:50
7楼2011-04-15 20:42:51
silicare(EPI+1): 2011-04-18 18:59:35
|
的确，不同的建树方法会的不同的遗传距离。 通常的建树方法为：Ｎｅｉｂｏｕｇ Ｊｉｏｎｔ， ｐａｒａｓｉｏｎ， Ｍａｘ Ｌｉｋｅｌｙｈｏｏｄ， ＵＰＧＭＡ． 此外大家喜欢加入ｂｏｏｓｔｒａｐ 通常为１００， 或者１０００、。 比如你建了一个树 The evolutionary history was inferred using the Neighbor-Joining method。 那么这个树的分支，和分支的长度是有意义的，这分枝的意义通过其长度来表示其遗传速率，突变率，进化率，等等，这些你都可以定义，如果默认的情况下： with branch lengths in the same units as those of the evolutionary distances used to infer the phylogenetic tree。也就是每一突变单位，等于一个单位的进化距离，等于一个单位的树长。 所以一个树的最主要的参考就是那个标尺，这个标尺也可以进行人文的标定：如 １个单位树长度＝两个突变率，＝０．１％进化率，等等，根据自己试验对象而定，并且一定标注参考文献，否则，就是采用上面的默认情况。 |
8楼2011-04-16 11:54:32
简单回复
2015-06-19 10:48
回复
