应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了
51/1返回列表
查看: 1847  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

finding1371

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了 已有4人参与

构建进化树，到底是基于核酸序列还是氨基酸序列，还是两者都可以用来建树呢，
比如这句话Phylogenetic tree for the strains of Acinetobacter based on the amino acid sequences of gvrB products by the neighbor-joining method.似乎是用氨基酸序列来建树吗。如果用核酸序列建树有何差异呢，关注理论讲解。真诚谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-13 19:29:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-08-13 19:41:31:
我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……

我想建的进化树是曲霉属间的，他们的氨基酸序列同源性在70%-99%不等，核酸同源性60%-90%左右，不知道是在核酸水平上建树还是在氨基酸水平上建树呢，顺便问你一下了，就是我用MEG4.0建树，树枝上怎么没有数字显示啊，bioeidt 可以建树吗，谢谢你了，呵呵

[ Last edited by finding1371 on 2010-8-13 at 19:57 ]
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-13 19:50:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
finding1371(金币+10):谢谢你呀，呵呵 2010-08-13 19:50:45
我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……
赞一下 回复此楼
2楼2010-08-13 19:41:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+3):鼓励一下！ 2010-08-13 20:27:09
你有没有选bootstrap检验啊？数字一般是表示进行1000次建树后，多少次得到这样的结果，我个人认为，你都可以建下，看哪个结果更能说明问题，还有就是看你要发表的杂志的需要了……
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-08-13 20:19:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-08-13 20:19:31:
你有没有选bootstrap检验啊？数字一般是表示进行1000次建树后，多少次得到这样的结果，我个人认为，你都可以建下，看哪个结果更能说明问题，还有就是看你要发表的杂志的需要了……

哦，好的，明白一点了，呵呵，再次谢谢你！
赞一下 回复此楼
5楼2010-08-13 20:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 296求调剂 +3 www_q 2026-03-18 6/300 2026-03-19 22:28 by zhq0425
[考研] 321求调剂 +8 何润采123 2026-03-18 10/500 2026-03-19 16:46 by 何润采123
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +3 llllkkkhh 2026-03-18 3/150 2026-03-19 14:22 by houyaoxu
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:07 by peike
[考研] 材料080500调剂求收留 +4 一颗meteor 2026-03-13 4/200 2026-03-19 10:32 by 30660438
[考研] 材料专硕英一数二306 +5 z1z2z3879 2026-03-18 5/250 2026-03-19 07:43 by BruceLiu320
[考研] 0703化学 305求调剂 +4 FY_yy 2026-03-14 4/200 2026-03-19 05:54 by anny19840123
[考研] 085600材料与化工 +5 安全上岸！ 2026-03-16 5/250 2026-03-18 15:33 by cmz0325
[考研] 0854可跨调剂，一作一项核心论文五项专利，省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[基金申请] 被我言中：新模板不强调格式了，假专家开始管格式了 +4 beefly 2026-03-14 4/200 2026-03-17 22:04 by 黄鸟于飞Chao
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗？ 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 080500，材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭