应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了
51/1返回列表
查看: 1694  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

finding1371

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】进化树问题求助（在线等）先谢谢了 已有4人参与

构建进化树，到底是基于核酸序列还是氨基酸序列，还是两者都可以用来建树呢，
比如这句话Phylogenetic tree for the strains of Acinetobacter based on the amino acid sequences of gvrB products by the neighbor-joining method.似乎是用氨基酸序列来建树吗。如果用核酸序列建树有何差异呢，关注理论讲解。真诚谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-13 19:29:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+3):鼓励一下！ 2010-08-13 20:27:09
你有没有选bootstrap检验啊？数字一般是表示进行1000次建树后，多少次得到这样的结果，我个人认为，你都可以建下，看哪个结果更能说明问题，还有就是看你要发表的杂志的需要了……
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-08-13 20:19:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
finding1371(金币+10):谢谢你呀，呵呵 2010-08-13 19:50:45
我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……
赞一下 回复此楼
2楼2010-08-13 19:41:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-08-13 19:41:31:
我认为，如果物种亲缘关系近的话，核酸序列会非常相似，可能建树就比较乱，物种亲缘关系远的话， amino序列也不会相关太大，可以建树，还有，有些基因不可以转化为amino，只能用核苷酸了……

我想建的进化树是曲霉属间的，他们的氨基酸序列同源性在70%-99%不等，核酸同源性60%-90%左右，不知道是在核酸水平上建树还是在氨基酸水平上建树呢，顺便问你一下了，就是我用MEG4.0建树，树枝上怎么没有数字显示啊，bioeidt 可以建树吗，谢谢你了，呵呵

[ Last edited by finding1371 on 2010-8-13 at 19:57 ]
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-13 19:50:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-08-13 20:19:31:
你有没有选bootstrap检验啊？数字一般是表示进行1000次建树后，多少次得到这样的结果，我个人认为，你都可以建下，看哪个结果更能说明问题，还有就是看你要发表的杂志的需要了……

哦，好的，明白一点了，呵呵，再次谢谢你！
赞一下 回复此楼
5楼2010-08-13 20:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭