24小时热门版块排行榜    

查看: 1110  |  回复: 3

andywang6137

木虫 (著名写手)

[求助] 请教:超家族基因扩增后确定类别及构建进化树

我用兼并引物扩增了目的基因,以前只管扩增,没考虑其他。现在要建树了,不知道如何确定其类别。NCBI比对,有的直接具体到某一小类别,有的名称直接就是大家族的名字。这种情况怎么办?
    进化树,其他序列怎么选?预测的,类似的序列,还有不同亚型的都要选吗?本人分子懂的不多,烦请高手赐教!
    先行谢过!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

andywang6137(金币+2): 谢谢指点 2011-10-04 18:50:43
即使不晓得到底是哪个类别的基因,只要你的序列足够多,做进化树是完全可以的。
2楼2011-10-03 07:35:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4): Good!专家辛苦! 2011-10-04 00:28:18
andywang6137(金币+5): 谢谢,不管多还是少,就是不知道怎么选序列。 2011-10-04 18:51:47
andywang6137(金币+13): 谢谢 2012-01-05 22:18:30
我做植物,也做过多基因家族,看你发表哪个类别的PAPER,如果是BMC类,序列一定要非常足够多,一般要100甚至更多,如果是其他一般刊物序列可以稍微少一些,只要能说明你的问题即可。
3楼2011-10-03 07:37:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by chenguestc at 2011-10-03 07:37:26:
我做植物,也做过多基因家族,看你发表哪个类别的PAPER,如果是BMC类,序列一定要非常足够多,一般要100甚至更多,如果是其他一般刊物序列可以稍微少一些,只要能说明你的问题即可。

序列是越多越接近真实的结果。尽量多挑克隆测序,序列可以考虑都用于分析。
4楼2011-10-04 18:55:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 andywang6137 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 211本,11408一志愿中科院277分,曾在中科院自动化所实习 +3 Losir 2026-03-12 3/150 2026-03-14 12:11 by 热情沙漠
[考研] 085600材料与化工 326 求调剂 +5 热爱生活ing 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:39 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +14 王晓阳- 2026-03-09 19/950 2026-03-14 02:05 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +5 简木ChuFront 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:29 by JourneyLucky
[考研] 一志愿郑大070303,338分,求调剂 +4 dadawaf 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:20 by lsw010101
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕,一志愿中国矿业大学,总分314,求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +9 Copy267 2026-03-10 9/450 2026-03-13 23:45 by userper
[考研] 285 求调剂 资源与环境 一志愿北京化工大学 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:04 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +3 miaodesi 2026-03-12 4/200 2026-03-13 20:53 by 18595523086
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123! 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
[考研] 0857 资源与环境 285分 +6 未名考生 2026-03-09 6/300 2026-03-11 21:08 by 30660438
[基金申请] 提交后的基金本子,已让学校撤回了,可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
信息提示
请填处理意见