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飞扬886

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】构建进化树前序列的处理问题

在构建进化树之前，比对好的序列往往需要处理一下，比如去除gaps等，但是不知道通常需要处理到一个什么样的程度比较合适？序列相似性比较低的区域是否也要去除呢，去掉太多序列会不会影响结果。请有经验者指教，谢谢！

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1楼 2011-02-24 17:07:17

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haitian0625

金虫 (小有名气)

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★
飞扬886(金币+5):谢谢参与

Clustal之后呢，产生的gap是不需要处理的。

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3楼2011-04-16 09:57:56

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秋电工

新虫 (小有名气)

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★
飞扬886(金币+5):谢谢参与

引用回帖:

Originally posted by 飞扬886 at 2011-02-24 17:07:17:
在构建进化树之前，比对好的序列往往需要处理一下，比如去除gaps等，但是不知道通常需要处理到一个什么样的程度比较合适？序列相似性比较低的区域是否也要去除呢，去掉太多序列会不会影响结果。请有经验者指教，谢 ...

mega4.0及以后更新版本的全歼中都嵌合了clustal，建树前，进行clustal一下。我这求了份说明书，也是初学，你若有需要我发你一份

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2楼2011-04-15 21:09:41

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