24小时热门版块排行榜    

查看: 2010  |  回复: 7

菜菜0929

木虫 (小有名气)

[求助] 急!!!这种基因克隆需不需要用RACE

转录组测序后筛选出差异基因,克隆这样的基因需要用RACE技术吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-29 21:35:56
菜菜0929: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-30 10:20:34
RACE是利用兼并引物P出一段序列,然后向两端延伸获得全长序列的方法。
你转录组都测序了克隆基因就不需要用RACE了。
2楼2013-12-29 21:09:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-29 21:09:45
RACE是利用兼并引物P出一段序列,然后向两端延伸获得全长序列的方法。
你转录组都测序了克隆基因就不需要用RACE了。

那我用什么方法?我看人家博士论文有用race的,我导师也让我用。可是我现在研三,没发文章没数据,也没有克隆过基因,我怕来不及毕业。有简单的方法给我提供一个,万分感谢

[ 发自小木虫客户端 ]
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
3楼2013-12-29 21:58:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-30 08:23:01
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-12-30 04:16:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 04:16:11
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

直接拿拼接出来的序列设计还是哪CDS序列设计呢?是要把序列比对到NCBI,得到相似序列,再用DNAman什么的设计吗
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
5楼2013-12-30 09:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 04:16:11
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

我刚才看了一下,你能不能帮我判断一下我这样的流程正不正确?
第一步,把转录组测序得到的其中一个差异基因序列输入OFR finder,的到了一个长的OFR
2.把得到的这个OFR的氨基酸序列放到NCBI Conserved domains检验,发现它属于一个蛋白家族,这说明我得到的OFR是正确的
第三步,利用这个OFR设计引物
第四步,从cDNA里用这个引物扩出全长

我这个流程是正确的吗?还有就是我第一步用来寻找OFR的序列是直接用我测序得到的序列还是用把测序序列比对到NCBI上得到的同源序列?(我之所以有这个疑问是因为老师说考虑到测序得到的序列是contig、unigene拼接出来的,可能不完全准确)
请帮我回答一下,万分感谢
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
6楼2013-12-30 10:33:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
菜菜0929: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-30 15:16:53
引用回帖:
6楼: Originally posted by 菜菜0929 at 2013-12-30 10:33:11
我刚才看了一下,你能不能帮我判断一下我这样的流程正不正确?
第一步,把转录组测序得到的其中一个差异基因序列输入OFR finder,的到了一个长的OFR
2.把得到的这个OFR的氨基酸序列放到NCBI Conserved domains检 ...

流程没问题,我认为根据测序结果设计引物就好了。确保万一的话你就设计两对引物好了,测序的一对,NCBI上得到的同源序列,哪个能P出来用哪个。
7楼2013-12-30 11:40:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 11:40:09
流程没问题,我认为根据测序结果设计引物就好了。确保万一的话你就设计两对引物好了,测序的一对,NCBI上得到的同源序列,哪个能P出来用哪个。...

非常感谢
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
8楼2013-12-30 15:17:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 菜菜0929 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:03 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:51 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:15 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:51 by 9i7PCSZyMzot
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:39 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-18 7/350 2026-09-19 21:03 by 9i7PCSZyMzot
[基金申请] 国社科系统bug了,是不是要放榜了? +7 kynobel 2026-09-16 9/450 2026-09-19 14:52 by 接好运婷
[考博] 申博发邮件 +8 Lmengk 2026-09-15 9/450 2026-09-19 09:27 by 中间体超市
[有机交流] 各位大神,目前国内有哪些比较好用的逆合成软件? 20+3 zapen 2026-09-15 9/450 2026-09-18 18:17 by zapen
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组|2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +8 两三岁ss 2026-09-14 8/400 2026-09-16 09:46 by 水士口
信息提示
请填处理意见