24小时热门版块排行榜    

查看: 1794  |  回复: 7

菜菜0929

木虫 (小有名气)

[求助] 急!!!这种基因克隆需不需要用RACE

转录组测序后筛选出差异基因,克隆这样的基因需要用RACE技术吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-29 21:35:56
菜菜0929: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-30 10:20:34
RACE是利用兼并引物P出一段序列,然后向两端延伸获得全长序列的方法。
你转录组都测序了克隆基因就不需要用RACE了。
2楼2013-12-29 21:09:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-29 21:09:45
RACE是利用兼并引物P出一段序列,然后向两端延伸获得全长序列的方法。
你转录组都测序了克隆基因就不需要用RACE了。

那我用什么方法?我看人家博士论文有用race的,我导师也让我用。可是我现在研三,没发文章没数据,也没有克隆过基因,我怕来不及毕业。有简单的方法给我提供一个,万分感谢

[ 发自小木虫客户端 ]
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
3楼2013-12-29 21:58:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-30 08:23:01
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-12-30 04:16:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 04:16:11
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

直接拿拼接出来的序列设计还是哪CDS序列设计呢?是要把序列比对到NCBI,得到相似序列,再用DNAman什么的设计吗
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
5楼2013-12-30 09:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 04:16:11
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

我刚才看了一下,你能不能帮我判断一下我这样的流程正不正确?
第一步,把转录组测序得到的其中一个差异基因序列输入OFR finder,的到了一个长的OFR
2.把得到的这个OFR的氨基酸序列放到NCBI Conserved domains检验,发现它属于一个蛋白家族,这说明我得到的OFR是正确的
第三步,利用这个OFR设计引物
第四步,从cDNA里用这个引物扩出全长

我这个流程是正确的吗?还有就是我第一步用来寻找OFR的序列是直接用我测序得到的序列还是用把测序序列比对到NCBI上得到的同源序列?(我之所以有这个疑问是因为老师说考虑到测序得到的序列是contig、unigene拼接出来的,可能不完全准确)
请帮我回答一下,万分感谢
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
6楼2013-12-30 10:33:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
菜菜0929: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-30 15:16:53
引用回帖:
6楼: Originally posted by 菜菜0929 at 2013-12-30 10:33:11
我刚才看了一下,你能不能帮我判断一下我这样的流程正不正确?
第一步,把转录组测序得到的其中一个差异基因序列输入OFR finder,的到了一个长的OFR
2.把得到的这个OFR的氨基酸序列放到NCBI Conserved domains检 ...

流程没问题,我认为根据测序结果设计引物就好了。确保万一的话你就设计两对引物好了,测序的一对,NCBI上得到的同源序列,哪个能P出来用哪个。
7楼2013-12-30 11:40:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 11:40:09
流程没问题,我认为根据测序结果设计引物就好了。确保万一的话你就设计两对引物好了,测序的一对,NCBI上得到的同源序列,哪个能P出来用哪个。...

非常感谢
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
8楼2013-12-30 15:17:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 菜菜0929 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 焦虑 +6 水冰月月野兔 2026-03-13 8/400 2026-03-16 06:39 by lfq_198989
[考研] 274求调剂 +4 时间点 2026-03-13 4/200 2026-03-15 15:29 by Rambo13
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 求调剂,药学 +3 归零lbm 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:21 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 招收0805(材料)调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 复试调剂 +9 Copy267 2026-03-10 9/450 2026-03-13 23:45 by userper
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 研究生招生 +3 徐海涛11 2026-03-10 7/350 2026-03-12 14:26 by 徐海涛11
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
[考研] 家人们 调剂不迷路 看这里 +8 likeihood 2026-03-09 13/650 2026-03-10 08:09 by likeihood
信息提示
请填处理意见