24小时热门版块排行榜    

查看: 1979  |  回复: 7

菜菜0929

木虫 (小有名气)

[求助] 急!!!这种基因克隆需不需要用RACE

转录组测序后筛选出差异基因,克隆这样的基因需要用RACE技术吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-29 21:35:56
菜菜0929: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-30 10:20:34
RACE是利用兼并引物P出一段序列,然后向两端延伸获得全长序列的方法。
你转录组都测序了克隆基因就不需要用RACE了。
2楼2013-12-29 21:09:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-29 21:09:45
RACE是利用兼并引物P出一段序列,然后向两端延伸获得全长序列的方法。
你转录组都测序了克隆基因就不需要用RACE了。

那我用什么方法?我看人家博士论文有用race的,我导师也让我用。可是我现在研三,没发文章没数据,也没有克隆过基因,我怕来不及毕业。有简单的方法给我提供一个,万分感谢

[ 发自小木虫客户端 ]
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
3楼2013-12-29 21:58:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-30 08:23:01
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-12-30 04:16:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 04:16:11
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

直接拿拼接出来的序列设计还是哪CDS序列设计呢?是要把序列比对到NCBI,得到相似序列,再用DNAman什么的设计吗
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
5楼2013-12-30 09:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 04:16:11
根据转录组测序和分析结果设计引物,从cDNA克隆你要的基因的完整ORF

我刚才看了一下,你能不能帮我判断一下我这样的流程正不正确?
第一步,把转录组测序得到的其中一个差异基因序列输入OFR finder,的到了一个长的OFR
2.把得到的这个OFR的氨基酸序列放到NCBI Conserved domains检验,发现它属于一个蛋白家族,这说明我得到的OFR是正确的
第三步,利用这个OFR设计引物
第四步,从cDNA里用这个引物扩出全长

我这个流程是正确的吗?还有就是我第一步用来寻找OFR的序列是直接用我测序得到的序列还是用把测序序列比对到NCBI上得到的同源序列?(我之所以有这个疑问是因为老师说考虑到测序得到的序列是contig、unigene拼接出来的,可能不完全准确)
请帮我回答一下,万分感谢
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
6楼2013-12-30 10:33:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
菜菜0929: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-30 15:16:53
引用回帖:
6楼: Originally posted by 菜菜0929 at 2013-12-30 10:33:11
我刚才看了一下,你能不能帮我判断一下我这样的流程正不正确?
第一步,把转录组测序得到的其中一个差异基因序列输入OFR finder,的到了一个长的OFR
2.把得到的这个OFR的氨基酸序列放到NCBI Conserved domains检 ...

流程没问题,我认为根据测序结果设计引物就好了。确保万一的话你就设计两对引物好了,测序的一对,NCBI上得到的同源序列,哪个能P出来用哪个。
7楼2013-12-30 11:40:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菜菜0929

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-30 11:40:09
流程没问题,我认为根据测序结果设计引物就好了。确保万一的话你就设计两对引物好了,测序的一对,NCBI上得到的同源序列,哪个能P出来用哪个。...

非常感谢
你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天,你所厌恶的现在是你回不去的曾经,活在当下
8楼2013-12-30 15:17:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 菜菜0929 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +4 kulium 2026-08-21 5/250 2026-08-21 17:45 by Equinoxhua
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 人气不行了 +7 fansofjerry 2026-08-21 7/350 2026-08-21 14:13 by Vivilian
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 18/900 2026-08-21 13:46 by 医学老男孩
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +15 kkkl_v 2026-08-19 16/800 2026-08-21 11:22 by 365372687
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +4 archvillain 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:10 by gatelove
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
请填处理意见