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PCR优化问题 求助
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小星丹925
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虫号: 1641800
[交流]
PCR优化问题 求助
这是我做148bp 的IL-2 梯度PCR图,首先我设计的引物具体信息是 S: 5' TGGCTGTATTTCGGTAGCAATG 3'
A: 5' TGGTGTGTAGAGCTCGAGATGAA 3' GT%,TM 值如图
体系为95度3min; 94度30s,退火梯度30s,72度30s 35个循环,72度5min
梯度pcr温度从左到右分别为 64, 63.3 ,59.6 ,56.7 .54.4,52.8
结果很奇怪,自己片段一个都没有出,出的片段比目的基因大,而且还有很多二聚体,求高人指点,问题出在哪呢?根据结果分析 引物,cDNA,pcr体系和退火温度的设定哪个设的不对么?请大家多给点意见,谢谢
还有哦,大家可以看下我的内参基因就跑出来了如图3,还挺亮的,不知道是不是能排除cDNA的问题呢?
图片2.png
IMG_1650.JPG
IMG_1651.JPG
图3 右边的pcr条带是B-actin内参.JPG
[
Last edited by 小星丹925 on 2013-12-5 at 10:19
]
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2013-12-03 13:16:43
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小星丹925
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6楼
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Originally posted by
huahu3600
at 2013-12-04 16:28:50
148bp那么短,直接全基因合成,500块钱搞定。
两头想加什么加什么。
啊?我是想做荧光定量,片段最好在150bp左右~~~
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7楼
2013-12-04 21:25:49
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gyesang: 金币+2, 鼓励交流!
2013-12-03 20:26:43
小星丹925: 金币+2
2013-12-05 10:20:01
不知道你那引物设计的位置可不可以改,至少可以看出你这引物设计的不合理,再看看引物设计的原则吧!换个位置设计吧
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2013-12-03 16:49:37
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2楼
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Originally posted by
yuxiangdan
at 2013-12-03 16:49:37
不知道你那引物设计的位置可不可以改,至少可以看出你这引物设计的不合理,再看看引物设计的原则吧!换个位置设计吧
怎么看出来的位置不合理呢?能详细说一下么?谢谢
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2013-12-03 17:43:49
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3楼
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Originally posted by
小星丹925
at 2013-12-03 17:43:49
怎么看出来的位置不合理呢?能详细说一下么?谢谢...
那引物设计软件有那么多found
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2013-12-03 18:31:37
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