24小时热门版块排行榜    

查看: 1821  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

08406224

新虫 (小有名气)

[交流] 关于引物设计的问题 已有4人参与

我在网上搜了下,都是讲软件的使用和引物设计的原则的,现在我有些基本的问题搞不清楚,想请教下大家。如果知道想扩增的序列,还需要找到这段学列两边的序列才能设计出引物吗?如果设计未知序列的引物又该怎么办?我的目的是要设计一个基因的通用引物,具体做法是把这个基因的所有序列都下载下来,然后做比对,拿保守区域直接作为引物来用吗?本人刚开始做的菜鸟,希望亲们能详细一些,不胜感激!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-14 23:15:26
有时候要看你的保守区多长。你从基因库下载序列也要看物种那些部分的,比如说线粒体基因等。拿保守区直接做引物,这个不太现实吧。
学习使你立于不败之地
6楼2013-11-12 16:24:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

simian1992

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
应该就是用保守区的基因序列来设计引物吧。
2楼2013-11-12 09:48:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu2883508

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-14 23:15:12
楼主如果是用未知序列没法设计引物的,如果你做的材料不知道序列,可以用它的近缘的物种,如单子叶参考水稻,双子叶参考拟南芥,或者参考模式植物的序列,如水稻,拟南芥,玉米,烟草等,不知道你的通用引物的目的是什么,如果只是扩增全长,就不在保守区域,如果是做表达,那就应该也不在保守区域~应该是该基因区别于其他所有基因的特异序列部分~
人生就是要不断的前进,忘掉不好的,记住好的向前行
3楼2013-11-12 11:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

08406224

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liu2883508 at 2013-11-12 11:14:05
楼主如果是用未知序列没法设计引物的,如果你做的材料不知道序列,可以用它的近缘的物种,如单子叶参考水稻,双子叶参考拟南芥,或者参考模式植物的序列,如水稻,拟南芥,玉米,烟草等,不知道你的通用引物的目的是 ...

是想把不同物种的同一基因一次扩增出来,用来做条形码的
4楼2013-11-12 14:43:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见