24小时热门版块排行榜    

查看: 2059  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

08406224

新虫 (小有名气)

[交流] 关于引物设计的问题 已有4人参与

我在网上搜了下,都是讲软件的使用和引物设计的原则的,现在我有些基本的问题搞不清楚,想请教下大家。如果知道想扩增的序列,还需要找到这段学列两边的序列才能设计出引物吗?如果设计未知序列的引物又该怎么办?我的目的是要设计一个基因的通用引物,具体做法是把这个基因的所有序列都下载下来,然后做比对,拿保守区域直接作为引物来用吗?本人刚开始做的菜鸟,希望亲们能详细一些,不胜感激!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu2883508

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-14 23:16:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by 08406224 at 2013-11-12 14:43:15
是想把不同物种的同一基因一次扩增出来,用来做条形码的...

楼主要做哪些物种的,如果是是同一个基因,你可以先在NCBI网站下载到所有序列,然后用http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/这个在线软件分析保守区域,然后在保守区域设计引物就行
人生就是要不断的前进,忘掉不好的,记住好的向前行
10楼2013-11-14 15:35:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

simian1992

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
应该就是用保守区的基因序列来设计引物吧。
2楼2013-11-12 09:48:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu2883508

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-14 23:15:12
楼主如果是用未知序列没法设计引物的,如果你做的材料不知道序列,可以用它的近缘的物种,如单子叶参考水稻,双子叶参考拟南芥,或者参考模式植物的序列,如水稻,拟南芥,玉米,烟草等,不知道你的通用引物的目的是什么,如果只是扩增全长,就不在保守区域,如果是做表达,那就应该也不在保守区域~应该是该基因区别于其他所有基因的特异序列部分~
人生就是要不断的前进,忘掉不好的,记住好的向前行
3楼2013-11-12 11:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

08406224

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liu2883508 at 2013-11-12 11:14:05
楼主如果是用未知序列没法设计引物的,如果你做的材料不知道序列,可以用它的近缘的物种,如单子叶参考水稻,双子叶参考拟南芥,或者参考模式植物的序列,如水稻,拟南芥,玉米,烟草等,不知道你的通用引物的目的是 ...

是想把不同物种的同一基因一次扩增出来,用来做条形码的
4楼2013-11-12 14:43:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +15 enenenhui 2026-03-13 16/800 2026-03-20 08:16 by wyb0328
[考研] 304求调剂 +4 曼殊2266 2026-03-18 4/200 2026-03-20 07:17 by Iveryant
[考研] 288求调剂 +15 于海海海海 2026-03-19 15/750 2026-03-19 22:41 by 学员8dgXkO
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +9 一鸭鸭哟 2026-03-14 11/550 2026-03-19 17:22 by !本暗一次!
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +10 慕寒mio 2026-03-16 10/500 2026-03-19 15:26 by 丁丁*
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 求调剂,一志愿:南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:07 by peike
[考研] 化学求调剂 +3 临泽境llllll 2026-03-17 4/200 2026-03-19 13:59 by houyaoxu
[考研] 346求调剂[0856] +3 WayneLim327 2026-03-16 6/300 2026-03-19 11:21 by WayneLim327
[考研] 一志愿天大材料与化工(085600)总分338 +5 蔡大美女 2026-03-13 5/250 2026-03-19 10:44 by 是小刘呀~
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +10 秋有木北 2026-03-14 10/500 2026-03-19 05:52 by anny19840123
[考研] 298-一志愿中国农业大学-求调剂 +7 手机用户 2026-03-17 7/350 2026-03-18 14:34 by vgtyfty
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +7 ZY-05 2026-03-13 8/400 2026-03-18 14:13 by 007_lilei
[考博] 环境领域全国重点实验室招收博士1-2名 +3 QGZDSYS 2026-03-13 5/250 2026-03-18 11:13 by QGZDSYS
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历,论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见