24小时热门版块排行榜    

查看: 9648  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

猫di阁楼

铜虫 (初入文坛)

[求助] 平末端加A尾连接T载体的问题 已有4人参与

各位亲,打搅了

我现在有一段融合片段想要连接T载体,用的是primer star所以产物是平末端,因为同学都反应平末端连接效率低,所以想加A尾巴再连接T载体。

加A尾时用的是TAKARA的DNA A-Tailing Kit,加A尾的体系如下:

buffer    5微
dNTP     4微
A-Tailing enzyme   0.5微
平末端DNA片段      约600ng(试剂盒的要求是达到0.5~5微克)
水          up  to 50微

我的片段长度有3740bp,与T载体连接时间为:16度2个半小时。

转入DH5a后,在氨苄蓝白斑平板上筛选到白色的菌落进行菌落PCR、提质粒、酶切验证。
酶切的结果不理想,空载体的大小为2692bp,酶切得到的片段大小为3500bp左右,我想问的是:
1.有人说连接的片段大于载体的大小会很难连,是这样吗?
2.酶切结果好像是只连上了一部分,是否是16度的反应时间太短?(说明书上写“长片段(2kb以上)进行克隆时,连接反应请延长至数小时。”咨询了TAKARA,说3740的片段要连多长时间,回复说不要超过3个小时。)
3.平末端连接是否还有更好的方法或者是经验,对于4000bp左右的平末端片段,怎样更有效的连上载体呢?

谢谢各位。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

蛋白表达纯化鉴定精华

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南海所老龚

新虫 (正式写手)

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-09-08 20:06:12
引用回帖:
3楼: Originally posted by tanche163 at 2013-10-27 22:42:36
很简单,注意一个细节:加完a尾后一定要切胶回收,去除小片段,因为小片段也有a尾,容易优先连接t载体,导致空载。至于片段大小,我连过5kb,没有问题。另外普通PCR体系加a尾也很好用,没必要买小日本的试剂盒,太贵 ...

亲,你好,看了你在小木虫上的留言,连接5K片段都不成问题,很是佩服。我最近深受克隆的摧残,片段2500 bp左右,一直克隆不上,向虫友学习,希望不吝赐教。期待您的回复,祝好!
TheBestandMostBeautifulThingsintheWorldCan'tBeSeenorTouched,TheyMustBeFeltwithHeart.
8楼2014-07-03 16:21:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

lcat

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-27 17:50:28
1 大片段确实比小片段难连接
2 怎么会“只连上一部分“呢?一般是要么连上,要么没连上啊。是不是用的酶有两个切点,正好把重组质粒切成两个3500bp左右的片段了?如果排除这个可能的话,只有多挑取转化子继续验证了。
3 实在不行可以用一些公司出的平端的克隆载体,直接往上连就行。
2楼2013-10-27 16:51:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tanche163

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2013-10-28 00:49:12
很简单,注意一个细节:加完a尾后一定要切胶回收,去除小片段,因为小片段也有a尾,容易优先连接t载体,导致空载。至于片段大小,我连过5kb,没有问题。另外普通PCR体系加a尾也很好用,没必要买小日本的试剂盒,太贵了
阳光总在风雨后
3楼2013-10-27 22:42:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

猫di阁楼

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tanche163 at 2013-10-27 22:42:36
很简单,注意一个细节:加完a尾后一定要切胶回收,去除小片段,因为小片段也有a尾,容易优先连接t载体,导致空载。至于片段大小,我连过5kb,没有问题。另外普通PCR体系加a尾也很好用,没必要买小日本的试剂盒,太贵 ...

请问一下,加尾的时候我用的是胶回收的产物,胶回收本来就损失比较大,加完A后再跑胶胶回收,会不会得到的产物更少呢?克隆的时候要求目的片段要达到一定的浓度嘛,这样会不会有影响?
4楼2013-10-28 19:22:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:44 by 4qO8zhfjr2AX
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:22 by 4qO8zhfjr2AX
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:11 by 4qO8zhfjr2AX
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 14:03 by jCd0dEvKHShX
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:02 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 11:18 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见