24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 9099  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

猫di阁楼

铜虫 (初入文坛)

[求助] 平末端加A尾连接T载体的问题 已有4人参与

各位亲,打搅了

我现在有一段融合片段想要连接T载体,用的是primer star所以产物是平末端,因为同学都反应平末端连接效率低,所以想加A尾巴再连接T载体。

加A尾时用的是TAKARA的DNA A-Tailing Kit,加A尾的体系如下:

buffer    5微
dNTP     4微
A-Tailing enzyme   0.5微
平末端DNA片段      约600ng(试剂盒的要求是达到0.5~5微克)
水          up  to 50微

我的片段长度有3740bp,与T载体连接时间为:16度2个半小时。

转入DH5a后,在氨苄蓝白斑平板上筛选到白色的菌落进行菌落PCR、提质粒、酶切验证。
酶切的结果不理想,空载体的大小为2692bp,酶切得到的片段大小为3500bp左右,我想问的是:
1.有人说连接的片段大于载体的大小会很难连,是这样吗?
2.酶切结果好像是只连上了一部分,是否是16度的反应时间太短?(说明书上写“长片段(2kb以上)进行克隆时,连接反应请延长至数小时。”咨询了TAKARA,说3740的片段要连多长时间,回复说不要超过3个小时。)
3.平末端连接是否还有更好的方法或者是经验,对于4000bp左右的平末端片段,怎样更有效的连上载体呢?

谢谢各位。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

蛋白表达纯化鉴定精华

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

猫di阁楼

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tanche163 at 2013-10-27 22:42:36
很简单,注意一个细节:加完a尾后一定要切胶回收,去除小片段,因为小片段也有a尾,容易优先连接t载体,导致空载。至于片段大小,我连过5kb,没有问题。另外普通PCR体系加a尾也很好用,没必要买小日本的试剂盒,太贵 ...

请问一下,加尾的时候我用的是胶回收的产物,胶回收本来就损失比较大,加完A后再跑胶胶回收,会不会得到的产物更少呢?克隆的时候要求目的片段要达到一定的浓度嘛,这样会不会有影响?
4楼2013-10-28 19:22:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

lcat

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-27 17:50:28
1 大片段确实比小片段难连接
2 怎么会“只连上一部分“呢?一般是要么连上,要么没连上啊。是不是用的酶有两个切点,正好把重组质粒切成两个3500bp左右的片段了?如果排除这个可能的话,只有多挑取转化子继续验证了。
3 实在不行可以用一些公司出的平端的克隆载体,直接往上连就行。
2楼2013-10-27 16:51:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tanche163

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2013-10-28 00:49:12
很简单,注意一个细节:加完a尾后一定要切胶回收,去除小片段,因为小片段也有a尾,容易优先连接t载体,导致空载。至于片段大小,我连过5kb,没有问题。另外普通PCR体系加a尾也很好用,没必要买小日本的试剂盒,太贵了
阳光总在风雨后
3楼2013-10-27 22:42:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tanche163

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-29 16:37:15
猫di阁楼: 金币+1, 有帮助 2013-10-30 21:20:45
引用回帖:
4楼: Originally posted by 猫di阁楼 at 2013-10-28 19:22:20
请问一下,加尾的时候我用的是胶回收的产物,胶回收本来就损失比较大,加完A后再跑胶胶回收,会不会得到的产物更少呢?克隆的时候要求目的片段要达到一定的浓度嘛,这样会不会有影响?...

PCR产物可以直接用纯化试剂盒先纯化一下,因为无论怎么操作都会伴随有断裂的DNA片段,这时候加a尾这些小片段也会被补齐并产生a尾,由于这些片段大小比目的片段小,所以会优先连接到T载体,因此加完a尾后一定要胶回收,你的“酶切结果好像是只连上了一部分”实际上就是断裂的小片段。
阳光总在风雨后
5楼2013-10-29 14:17:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291求调剂 +3 关忆北. 2026-04-14 3/150 2026-04-14 22:53 by 梁家伟
[考研] 求助调剂,跨调 +18 X十甫寸Y 2026-04-11 19/950 2026-04-14 19:26 by Art1977
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +7 lzmk 2026-04-14 7/350 2026-04-14 17:02 by lihaoda1994
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +6 喽哈加油 2026-04-13 6/300 2026-04-14 16:40 by zhouxiaoyu
[考研] 考研英一数一338分 +9 长江大学东校区 2026-04-13 10/500 2026-04-14 00:41 by 王珺璞
[考研] 302求调剂 +10 易!? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 284求调剂 +11 archer.. 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:23 by 蓝云思雨
[考研] 283求调剂 +22 那个噜子 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 10:41 by 逆水乘风
[考研] 工科273调剂 +6 X1999 2026-04-09 7/350 2026-04-11 10:23 by zhq0425
[考研] 22408 352分求调剂0854类 +4 努力的夏末 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:57 by zhq0425
[考研] 265求调剂 +12 风说她早忘了 2026-04-10 13/650 2026-04-10 18:56 by chemisry
[论文投稿] mdpi小修rvr时间四五天了 20+3 哈哈high 2026-04-08 5/250 2026-04-10 16:02 by 北京莱茵润色
[考研] 085800 能源动力求调剂 +6 阿biu啊啊啊啊啊 2026-04-10 6/300 2026-04-10 15:03 by hemengdong
[考研] 一志愿华东师范生物学326分,求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考研] 296求调剂 +6 汪!?! 2026-04-08 6/300 2026-04-10 11:02 by mattzhming
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-08 3/150 2026-04-08 22:00 by zhouyuwinner
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂,接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
信息提示
请填处理意见