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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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浅笑包包

新虫 (小有名气)

[求助] 荧光定量PCR

荧光定量PCR的引物可以用来做一般的PCR吗?最近要做荧光定量,设计了荧光定量的引物,先提取RNA, 然后反转录成cDNA,就用荧光定量的引物来做一般的PCR,扩增一个基因,还做了一个不加模板的阴性对照,跑胶后发现对照与实验组的条带一样,可能是发生了引物二聚体的现象,是引物出问题了吗?不能用荧光定量的引物做一般的PCR,但是我导师说可以,求证??、
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
浅笑包包: 金币+5, ★★★很有帮助, 三克油~受教啦~~ 2013-09-18 07:48:38
1.可以。扩增条件可以和定量相同。实际上有时为了省荧光染料,在摸realtimePCR条件时我们常常用realtime的引物用普通PCR摸条件。2.一般荧光定量引物的二聚体是最少的。因为realtimePCR要严格控制二聚体。3.阴性对照出结果,可能是出现了污染。二聚体和目的条带从电泳上一般能分辨出来。二聚体都低于100bp,亮度大,有弥散。realtimePCR的目的序列一般都设计成100~150bp,最长不超过300bp。不建议设计100bp以下的片段,太难和引物二聚体区分了。4.普通PCR的目的是什么?得到目的片段然后进行克隆,realtime的引物是不行的,片段太短,有时甚至不是开放阅读框,没有酶切位点,没调节阅读框无法正确表达。补充半定量的电泳结果是可以的,可以选realtimePCR对数期最大的循环做普通PCR,电泳,软件分析图像。
5楼2013-09-17 19:37:39
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sageyaya

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-16 14:14:23
是可以的,但是比较麻烦,因为你要通过跑很多次找到一个对数期,如果按照平时的PCR的循环数,很有可能已经过了,已经在平台期了,而且增减很不明显。最好是做荧光定量PCR,方便简单。
另外不加模板的也有带,考虑一下是不是发生污染。
2楼2013-09-16 13:55:50
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浅笑包包

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sageyaya at 2013-09-16 13:55:50
是可以的,但是比较麻烦,因为你要通过跑很多次找到一个对数期,如果按照平时的PCR的循环数,很有可能已经过了,已经在平台期了,而且增减很不明显。最好是做荧光定量PCR,方便简单。
另外不加模板的也有带,考虑一 ...

我的意思是我有荧光定量的引物,可以用这个引物来做一般的PCR吗?
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3楼2013-09-16 16:56:03
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sageyaya

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 浅笑包包 at 2013-09-16 16:56:03
我的意思是我有荧光定量的引物,可以用这个引物来做一般的PCR吗?...

你指的做一般的PCR是要割胶回收,连接什么的么?那是不行的,因为引物只是用来定量的,通常在300bp以内,并不是某个基因的全长,当然,如果的你的基因很短,这个引物已经能够P出来,应该可以吧,
如果是要通过PCR手段来进行定量是可以的。
4楼2013-09-17 19:16:28
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