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lhl2225

金虫 (正式写手)

[求助] 求长片段(7.5 kb)PCR扩增方法? 已有2人参与

目前手头有个工作,需要克隆一个基因的全长。
模板已经过测序,是没有问题的。

遇到问题:
1. 两端设计引物,试了LA taq,KOD,Taq等P不出来。
2.中间设计引物分段P,也P不出来。
3.直接在中间设计两条引物,随便P一段也P不出来。

急!!!

求高人指点!如果根据您的建议P出来了,将赠送100金币酬谢。
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我想做到的一定能成功!自信不是简单地渴望别人认可你,你要在内心深处觉得,我可以。这样就不用理会别人的怀疑或轻视。
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liyongliangx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
模板的浓度? 加的量呢?引物的量?酶的量?
你P不出来的胶图是什么样子的?
2楼2013-08-01 19:03:39
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hyphen007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
从模板、引物、反应条件等方面找原因
3楼2013-08-01 19:27:55
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lhl2225

金虫 (正式写手)

20μL体系:
ddH2O: 14.5 μL
buffer:2
dNTP(2.5mM each):1.6
F (10uM):0.5
R(10uM):0.5
模板:20 ng
rTaq:0.4

P不出来就是只见引物二聚体,无目的条带!
DMSO:0.2
我想做到的一定能成功!自信不是简单地渴望别人认可你,你要在内心深处觉得,我可以。这样就不用理会别人的怀疑或轻视。
4楼2013-08-01 19:34:13
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-08-02 09:36:43
模板是gDNA, cDNA?PCR的程序是怎样的,引物的退火温度优化了没有?
5楼2013-08-02 04:14:42
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lhl2225

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-08-02 04:14:42
模板是gDNA, cDNA?PCR的程序是怎样的,引物的退火温度优化了没有?

20μL体系:
ddH2O: 14.5 μL
buffer:2
dNTP(2.5mM each):1.6
F (10uM):0.5
R(10uM):0.5
模板:20 ng 质粒
rTaq:0.4

P不出来就是只见引物二聚体,无目的条带!
DMSO:0.2
我想做到的一定能成功!自信不是简单地渴望别人认可你,你要在内心深处觉得,我可以。这样就不用理会别人的怀疑或轻视。
6楼2013-08-06 08:50:46
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by lhl2225 at 2013-08-06 08:50:46
20μL体系:
ddH2O: 14.5 μL
buffer:2
dNTP(2.5mM each):1.6
F (10uM):0.5
R(10uM):0.5
模板:20 ng 质粒
rTaq:0.4

P不出来就是只见引物二聚体,无目的条带!
DMSO:0.2...

质粒加20ng太多了,稀释100-1000倍再P
7楼2013-08-06 11:07:11
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tmaclhf

铁虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

长片段可以用两步PCR法。变性后直接来个65度8分钟
8楼2013-08-06 11:12:45
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simojie

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

1. rTaq肯定没有LA-Taq效果好;
厚积薄发
9楼2013-08-06 17:36:38
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

建议LZ用北京全式金的fast pfu,2-4kb/m
看样子,LZ的基因序列比较特别,估计是高GC或者是高AT的,如果是高GC的就加点高GC buffer.
10楼2013-08-06 17:44:04
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