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joyjane88

铜虫 (初入文坛)

[交流] PCR扩增法制备低拷贝质粒(替代常规质粒提取)已有8人参与

大家好,近期构建一载体,但所用出发载体质粒是低拷贝的(约20个copies),但不是很大(5-6K)。每次用小提试剂盒提取得到的样品量很低(10-20ng/ul),很不利于后期的酶切连接及转化。本人想通过pcr的方法扩增来制备这个质粒(制备量应该可以达到50ng/ul以上,而且可以扩增好多管),但没有查到相关的方法(有用PCR扩增制备定点突变质粒的,但没有看到制备常规质粒的PCR)。想问问大家可行吗?欢迎大家给出宝贵意见。
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liuyu_sdili

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
amisking(金币+4): 鼓励积极应助! 2012-02-22 20:43:13
楼主用的应该是在大肠杆菌里面的穿梭质粒吧?质粒用的什么复制起始位点?如果是跟pBR322一样的话,可以用氯霉素扩增的办法增加质粒拷贝~~~
如果不这样的话,也可以做质粒中提,方法试剂分子克隆上有的~~~
至于你的方法,我还没听说。。。。。。。
2楼2012-02-22 14:51:48
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quiller2000

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
amisking(金币+5): 鼓励积极应助! 2012-02-22 20:43:19
问题是你的引物啊!我们通常的引物的末端都是-OH,在体外可不好直接形成磷酸二酯键呢!而做磷酸化我不知道会不会两端都磷酸化了!

而site-direction kit最后是通过细胞来扩增的;,单链进入细胞后再复制生成的。因此,你还是要好好考虑一下!

PS,20 copie还是很多的,增加一下细胞的量应该是没有问题的,做克隆神马的还是很容易的,除非你要去转染细胞什么的,那到是一个体力活儿,呵呵!

Good luck!

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致良知
3楼2012-02-22 15:55:40
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joyjane88

铜虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by quiller2000 at 2012-02-22 15:55:40:
问题是你的引物啊!我们通常的引物的末端都是-OH,在体外可不好直接形成磷酸二酯键呢!而做磷酸化我不知道会不会两端都磷酸化了!

而site-direction kit最后是通过细胞来扩增的;,单链进入细胞后再复制生成的 ...

thanks a lot!
4楼2012-02-22 16:25:01
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joyjane88

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by liuyu_sdili at 2012-02-22 14:51:48:
楼主用的应该是在大肠杆菌里面的穿梭质粒吧?质粒用的什么复制起始位点?如果是跟pBR322一样的话,可以用氯霉素扩增的办法增加质粒拷贝~~~
如果不这样的话,也可以做质粒中提,方法试剂分子克隆上有的~~~
至于你 ...

好像跟pBBR322有点血缘呢,这种方法可使拷贝数增加到什么水平?
5楼2012-02-22 16:26:35
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)

这个会突变的
6楼2012-02-22 18:44:44
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AnaSequence

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
可以的,最好直接跟目的片段重叠,可以不用酶切,连接了.相关参考文献论坛和DXY有,也可以搜索无连接酶克隆和重叠PCR,反向PCR方面的资料.一般都要求用高保真酶来PCR.
7楼2012-02-22 19:13:16
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liuke525

至尊木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
用PCR扩增有点不太保险,楼主可以试试中抽啊,20copie的增加下菌液、洗脱的时候少用点洗脱液,提取的浓度还是能上来的。
8楼2012-02-22 20:16:03
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liuyu_sdili

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
可以的达到上千吧,相关信息详细看一下分子克隆中文第三版上册第十五页~~~
9楼2012-02-22 22:02:41
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馋猫

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
大提质粒就是了,你都能跑出来,浓度还过得去吧
有哪些时间不如多培养点大提质粒得了
10楼2012-02-23 11:28:41
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