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皇马铁卫

铜虫 (正式写手)

[求助] 毕赤酵母电转

做了很久毕赤酵母GS115的电转化。转的是DNA片段,双交换敲除基因。
转化方法用的是Wu S, Letchworth G J. High efficiency transformation by electroporation of pichia pastoris pretreated with lithium acetate and dithiothreitol[J]. Biotechniques, 2004, 36(1): 152-155
1. 50mlYPD摇菌至OD 1.5~2.0
2. 收集菌体。每10ml作一管收集,即为一个感受态
3. 每管以8 mL LDST( 100 mM LiAc, 10 mM DTT,0.6 M sorbitol, and 10 mM Tris-HCl,    pH 7.5)室温处理30min
4. 4℃离心。以1ml预冷的1M 山梨醇洗三次
5. 最后以80微升预冷的1M 山梨醇重悬。感受态浓度约为10^10个细胞/mL
电转条件1500V,25μF,200Ω(这个条件的电转仪要去别的实验室借用,本实验有的电转仪是1500V,36μF,186Ω,两种条件都用过)。2mm电击杯。
DNA量10~100ng,溶于5~10μL水中。混合后冰浴5min。(电转仪预热,电击杯预冷)。电击后迅速加入1ml 预冷的1M 山梨醇。30℃孵育1.5h。然后加入1mlYPD,150rpm摇2~3h。取200μL涂板(YPD含1M山梨醇,300μg/ml G418)

每次结果都是长3~4天无明显克隆。5~6天时长满背景克隆(有挑出验证过,都是假阳性)。阴性对照基本不长的。前后做了几十次了。就得到2个阳性克隆。有很多时候,能长出几个克隆。重新划线于G418平板上,仍然可以长,但是提基因组PCR验证都不对。
做的都快吐了求虫友们给点意见!

[ Last edited by 皇马铁卫 on 2013-7-3 at 15:45 ]
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2楼2013-07-03 15:53:44
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lwiaanngg

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 回答很好,perfect 2013-07-04 17:27:14
皇马铁卫: 金币+2, 有帮助, 我转化的是DNA片段,不存在ligation的问题哦 2013-07-06 15:46:13
1. 你这个问题比较复杂,从描述上看,你的ligation做的如何呢?如果你的ligation效果不好,即使你的电转效率再高,你拿到都是背景克隆。如果你的plasmid是transfer vector,可以考虑先用e.coli做完ligation,等提出很好的positive plasmid后再转入酵母中。
2. 个人建议你做competent cell时用瓶子而不是管子,呵呵
3楼2013-07-04 17:10:43
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ericyo918

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
皇马铁卫: 金币+2 2013-07-10 09:07:22
试试钙转,一个方法不行换另外一个,呵呵。
4楼2013-07-04 17:44:48
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带刺毛毛虫

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 完全认同 2013-07-05 16:11:37
皇马铁卫: 金币+2, z这个问题帖子中提到的 2013-07-06 15:47:01
好像你的DNA量太少了吧,还有你电击后要立即马上加上山梨醇悬起来,要求非常快的。
加油
5楼2013-07-05 10:10:03
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hj890509

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
皇马铁卫: 金币+2 2013-07-10 09:07:32
DNA量应该5~10ug,另外电转2mm的电压应该是2500v
6楼2013-07-05 15:50:42
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84146922

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
皇马铁卫: 金币+10, 你说的问题我都注意过的,还是感谢下 2013-07-06 15:40:36
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-07-07 17:31:21
1.DNA是线性化后吗?线性化后必须PCR纯化,离子对电转的效率影响很大
2.电压电阻我觉得没有问题,因为我们实验室也是一样的。
3.你使用G418抗性,那应该是9K载体吧,可以试试使用MD平板,我们在使用zeocin抗性YPD平板时,只是30℃孵育1.5h,直接涂布了。后面并没有加入YPD等步骤。
4.如果3-4天都没有克隆,那就不会有阳性克隆了(实验室经验)。
5.我们实验室是50mlYPD摇菌至OD 1.5~2.0,直接离心,去上清,加入40mlLDST(现配),30摄氏度孵育30min。LDST一定要现配,里面有DTT......不知道是不是这些问题
6.电击杯是正常的吗??之前使用有木有问题...
暂时看到这些问题....希望能帮助你
7楼2013-07-05 17:18:27
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84146922

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 感谢应助! 2013-07-07 17:31:57
对了,这有篇文章,可以参考...

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  • 附件 1 : 毕赤酵母高效电转化方法.pdf
  • 2013-07-05 17:26:06, 166.4 K
8楼2013-07-05 17:20:04
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皇马铁卫

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 84146922 at 2013-07-05 17:20:04
对了,这有篇文章,可以参考...

这篇文章就是我帖子中提到的文献
春晓赏花,夏日听蝉,箫吹秋月,酒饮冬霜~
9楼2013-07-06 15:36:24
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皇马铁卫

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lwiaanngg at 2013-07-04 17:10:43
1. 你这个问题比较复杂,从描述上看,你的ligation做的如何呢?如果你的ligation效果不好,即使你的电转效率再高,你拿到都是背景克隆。如果你的plasmid是transfer vector,可以考虑先用e.coli做完ligation,等提出 ...

转的是DNA片段啊,不存在连接的问题
春晓赏花,夏日听蝉,箫吹秋月,酒饮冬霜~
10楼2013-07-06 15:37:16
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