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weebug

版主 (著名写手)

[求助] 求解酶切状况

请问各位大侠,在跑道4,8,10 的拖尾现象做何解呢?这些是基因组DNA在隔夜酶切后跑胶的结果。模板大概1ug, 酶10U, 总容量10ul.

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天蓝蓝兮日头晒
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
酶切,切乱了,多种大小的碎片同时存在。
没有切的基因组没跑一个做对照?也许是基因组降解 也说不定
2楼2013-01-17 15:34:19
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zhang881007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
量少,酶切时间不够。或许照相曝光的时间再延长些,照片效果都会好些
shine
3楼2013-01-17 15:43:07
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platanus

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
weebug: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-01-17 16:40:50
基因组DNA因为比较大,片段里面会有大量的酶切位点,酶切之后会形成长短不一的片段,电泳之后会形成弥散的条带(酶切效果好的情况下)。你的酶切图还有非常明显的主带,说明酶切效果很不好,你的DNA还需要继续纯化之后才能做。
4楼2013-01-17 16:13:10
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weebug

版主 (著名写手)

谢谢各位,dna提纯的话,我会用苯:氯法,然后酒精洗一洗。 不知各位如何见解。
天蓝蓝兮日头晒
5楼2013-01-17 16:45:54
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★
amisking: 金币+3, 鼓励积极发帖帮助解答问题。 2013-01-18 20:31:52
amisking: 回帖置顶 2013-01-18 20:31:55
切基因组DNA弥散是很正常的,因为切过后分子大小不一。弥散说明你的酶切效果是不错的。1μg总DNA没有切过的话也不是特别亮的,切完后变弥散应该看不到什么了。如果想看的话可以加大DNA用量。
6楼2013-01-18 08:15:59
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weebug

版主 (著名写手)

不知胶的浓度有没影响,通常我大概1到1.5%。 应不会用PFGE吧?
天蓝蓝兮日头晒
7楼2013-01-18 16:05:38
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dayulee

木虫 (正式写手)

愚木虫

感觉是没有酶切完全。
好好学习,天天向上
8楼2013-01-18 23:23:08
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zg1415

金虫 (正式写手)

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励 2013-01-21 11:39:46
LZ可以适当加大DNA用量,做时间梯度,比如半小时或一小时一次,选择电泳条带最均匀的那个酶切时间,个人感觉你的酶切时间太长~ DNA纯化可以用酚:氯仿:异戊醇抽提几次去掉多余蛋白~,再用乙醇或者异丙醇沉淀后加dd水溶解即可~
一直被模仿,从未被超越
9楼2013-01-21 09:42:57
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