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听雪看山

木虫 (职业作家)

西游家族之T所长

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[交流] 【求助/交流】单酶切载体竟然没切开,寻求原因??已有5人参与

我用的载体是5500bp,酶是XmaI,去过磷酸化的。这个酶切已经做过n多次了,插入基因就是没办法和载体连接上,自连现象严重。当时以为是去磷酸化步骤的问题,然后就做过2次去磷酸化。
     后来在做完酶切后做了一个转化,将50ng酶切液用电子穿孔仪转入感受态细胞,隔夜培养后发现n多菌斑,那就是意味着没有酶切成功,心里这个郁闷啊!
     我用的这个酶据说是比较难反应的,所以当时酶切都是隔夜至少10个小时以上了!!

     我现在真的是一点办法也没有了,本来就是新手,第一次做,竟然还碰到这么大的问题,3个月了,一点进展都没有,着急啊!
     恳请高手们给点建议,小虾米在这多谢了!!
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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听雪看山(金币+1):谢谢参与
这个酶还可以啊,不是那么的难切,载体酶切后要用CIP去磷酸化一下,你的去磷酸化石如何处理的?
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2010-02-08 22:04:25
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听雪看山

木虫 (职业作家)

西游家族之T所长

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引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2010-02-08 22:04:25:
这个酶还可以啊,不是那么的难切,载体酶切后要用CIP去磷酸化一下,你的去磷酸化石如何处理的?

我用SAP,是Promega公司的。怀疑过去磷酸化出状况,可是现在貌似状况在酶切上。
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3楼2010-02-08 22:25:47
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biogefart

木虫 (著名写手)


听雪看山(金币+1):谢谢参与
这种情况换个其他公司的酶试试
闹太套
4楼2010-02-09 01:22:17
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yang0071

木虫 (职业作家)


听雪看山(金币+1):谢谢参与
酶切反应体系是多少?
酶的比例?并不是酶越多越好的,注意吸酶时,枪头不要挂液滴
反应时间太长,会很多水蒸发到盖子上,体系就变了,基本上2-3小时足够了
换个公司的酶也是个选择
只需要在载体上去磷酸化,目的片段不要去磷酸化,CIAP挺好用的
5楼2010-02-09 10:51:07
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听雪看山

木虫 (职业作家)

西游家族之T所长

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我通常反应体系是2ng,30ul。3ulbuffer,3ul  bsa, 1ul酶,反应3小时,但是总不奏效,后来看过产品说明,说这个酶推荐在37度16小时过夜反应的。后来就这么干了,结果还是不好。

是不是我体系总体积太大了,缩小点可行不
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6楼2010-02-09 20:43:23
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wangjiasi

木虫 (正式写手)


听雪看山(金币+1):谢谢参与
体系不大,可以再大一些,然后加大酶量~
2ng??太少了吧
酶切后可以跑电泳看看是否切开了,如果一点都没切开可能是甲基化的问题
7楼2010-02-11 13:50:28
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听雪看山

木虫 (职业作家)

西游家族之T所长

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在酶切完,纯化后,我做了转移,第二天看板子发现菌斑很多(估计500以上)。后来不甘心有做了去磷酸化,又做了次转移,二次发现还是很多菌斑但是明显少于未去磷酸化的板子。
这个能说明什么不?


下面是酶切凝胶回收的图,貌似不太好,不敢确定!!

左边是酶切的载体,右边是对照未酶切的载体

[ Last edited by 听雪看山 on 2010-2-11 at 16:23 ]
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8楼2010-02-11 16:21:59
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听雪看山

木虫 (职业作家)

西游家族之T所长

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做了2组酶切
这个体系总量2ng,20ul。2ul酶,2ulBSA,2ul Buffer 37度16小时酶切。
凝胶电泳只用1ul检测,载体直接用试剂盒纯化。

分别也是在酶切后和去磷酸化后做了转移,查看菌斑情况,结果和上面一组相同

下面是酶切电泳图,左是酶切载体,右面是未酶切载体
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9楼2010-02-11 16:31:06
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听雪看山

木虫 (职业作家)

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引用回帖:
Originally posted by biogefart at 2010-02-09 01:22:17:
这种情况换个其他公司的酶试试

老板怎么会轻易换呢,何况这个也没用完,人家其他人用都好着呢,就我这菜鸟的问题多! 不过老板认为这个试剂公司的没很好啊!呜呜,再给个可行的办法噻
开花可要欣赏,然后就去远行;唯有不等花开,才能记得花红。
10楼2010-02-11 16:34:00
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