| 查看: 4510 | 回复: 21 | |||
[求助]
16S rDNA测序问题 已有2人参与
|
|||
|
各位前辈，我想请教一下16S rDNA测序问题。我要鉴定一个未知菌，用试剂盒提基因组DNA，然后用通用引物PCR，在1500bp处有很亮的条带，又将PCR产物割胶纯化，然后送去测序，测了两次都没测通。测序公司给了我一下三个可能性。 1.已纯化的PCR样品造成这种情况的原因是由于模板纯化有一定问题，模板中含有非特异性的条带； 2.如果是未纯化的PCR产物，那么有可能是您要求测序的片段周围含有大小相近的条带，我们通过琼脂糖凝胶回收，无法有效切除这种大小差别不是很明显的条带； 3.模板或是引物质量较差，测序反应结束之后没有产生足够的目的产物，导致测序信号较弱，杂背景较高，形成重叠现象。 我看了一些文献，好多就是直接把PCR产物测序，我这个也有条带啊，怎么就测不出来呢？我怀疑是我的菌不够纯，都划线6次以上了。请各位前辈们看看我这问题出在哪里了？ 还有，对于鉴定菌我一直迷茫是先做生理生化鉴定还是先做16S鉴定，做生理生化鉴定我不知道该做哪些指标。。。 |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿大连理工大学材料求调剂
已经有5人回复
-
材料与化工调剂一志愿大连海事085600，349
已经有6人回复
-
一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂
已经有4人回复
-
材料科学与工程调剂
已经有11人回复
-
311求调剂一志愿合肥工业大学
已经有4人回复
-
一志愿食品科学与工程083200求调剂
已经有4人回复
-
材料科学与工程求调剂
已经有10人回复
-
一志愿北化085600材料专硕275|有文章专利｜求调剂
已经有11人回复
-
一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕
已经有4人回复
-
085600材料与化工调剂
已经有15人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 细菌16S rDNA测序结果有了，如何建立系统发育树啊，之前的贴子没看懂。
已经有9人回复
- 16s RNA鉴定细菌测序需要多少钱
已经有12人回复
- 细菌16S测序 诡异的现象
已经有11人回复
- 求助土壤总DNA提取和16S rDNA扩增
已经有15人回复
- 关于16s RNA测序
已经有3人回复
- 为什么细菌鉴定需要结合生理生化和16S rDNA鉴定
已经有3人回复
- 16S rDNA和16S rRNA区别
已经有3人回复
- 16SrDNA测序问题
已经有14人回复
- 对细菌进行测序时，测的是16S rDNA还是16S rRNA
已经有25人回复
- 正反向测序问题
已经有4人回复
- 半年了，16S rDNA V3区PCR产物弥散，疑似比目的条带大一些些的杂带？
已经有7人回复
- 16S测序结果不一样什么原因？
已经有7人回复
- 线粒体测序问题
已经有10人回复
- 用16S测序鉴定单一菌株的困惑
已经有15人回复
- 哪个公司做16S的高通量测序好？
已经有8人回复
- 土壤微生物16s rDNA 18s rDNA 抑制扩增不出来？？？？？？
已经有12人回复
- 做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法！！
已经有18人回复
- 16S rRNA 和16S rDNA的区别
已经有10人回复
- 16S rDNA测序问题
已经有3人回复
- 16s rDNA 扩增引物的选择
已经有9人回复
- 16S PCR扩增的问题
已经有11人回复
- DEEG条带测序问题
已经有7人回复
- 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急！！！
已经有6人回复
girlfisher
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 1292.1
- 红花: 2
- 帖子: 105
- 在线: 55.9小时
- 虫号: 1049679
- 注册: 2010-06-30
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
3楼2012-07-20 09:52:13
tankleiming
新虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 4.3
- 散金: 72
- 红花: 5
- 帖子: 220
- 在线: 201小时
- 虫号: 1433397
- 注册: 2011-10-09
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
15楼2012-07-24 21:28:43
2楼2012-07-20 09:16:35
baopeng
木虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 3629.8
- 散金: 20
- 红花: 1
- 帖子: 313
- 在线: 329.8小时
- 虫号: 234570
- 注册: 2006-03-31
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
4楼2012-07-20 12:23:15
tingspdf
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 11292.8
- 散金: 137
- 红花: 3
- 帖子: 2033
- 在线: 1241.2小时
- 虫号: 875792
- 注册: 2009-10-18
- 专业: 环境微生物学
5楼2012-07-20 15:41:38
shicaozhu
银虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 509.3
- 帖子: 88
- 在线: 16.2小时
- 虫号: 961463
- 注册: 2010-03-04
- 性别: MM
- 专业: 微生物遗传育种学
6楼2012-07-20 19:16:53
shicaozhu
银虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 509.3
- 帖子: 88
- 在线: 16.2小时
- 虫号: 961463
- 注册: 2010-03-04
- 性别: MM
- 专业: 微生物遗传育种学
7楼2012-07-20 19:17:28
8楼2012-07-20 20:58:53
tingspdf
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 11292.8
- 散金: 137
- 红花: 3
- 帖子: 2033
- 在线: 1241.2小时
- 虫号: 875792
- 注册: 2009-10-18
- 专业: 环境微生物学
9楼2012-07-21 00:02:13
jipojiong
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2127.6
- 散金: 27
- 红花: 2
- 帖子: 299
- 在线: 100.7小时
- 虫号: 907876
- 注册: 2009-11-20
- 性别: GG
- 专业: 中药质量评价
10楼2012-07-21 16:42:13
