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【求助/交流】基因克隆到底目的何在?
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hqc87
铁虫
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虫号: 867886
[交流]
【求助/交流】基因克隆到底目的何在?
验证一个小麦品种中是否含有一个特定基因比如植物的抗逆基因CBF4,一般的做法是根据CBF4的序列设计引物,然后以待检测小麦基因组DNA为模板进行扩增,得到条带就说明该小麦品种含有该基因,此处有一问题就是在设计引物时不一定是从基因的两端开始的对吧?比如假设CBF4完整基因是1000bp的话,而在线设计引物可能得到位于该基因内部的两个上下引物,这样用这对基因内部引物得到的pcr产物很可能只有300个bp左右,这样如果经pcr得到300bp的产物,也能说明该小麦品种含有该基因吗?得到300bp的pcr产物后将条带从胶上切下来,和载体连接转化等等,最后测序,这应该就是所谓的基因克隆吧,那最后测序的结果是不是也是那个连接上去的300bp片段的序列,得到这个300bp的序列有什么目的呢?在设计引物时就明明知道这两个上下游引物间的300bp的序列啊,所以这一切的目的是什么?
小弟不才,刚步入研究阶段,可能问题比较可笑,
希望各位大虾耐心解我疑惑,感激不尽!
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dhd997(金币+1): 感谢交流 2011-02-18 10:50:56
hqc87(金币+1): 2011-02-18 17:02:38
得到300bp片段的序列后,再根据此片段设计引物,应用商品化的试剂盒克隆3,与5,末端,从而获得全长基因序列
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2011-02-18 09:01:56
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dhd997(金币+5): 谢谢交流 2011-02-18 10:51:06
hqc87(金币+3): 正中要点,非常感谢!! 2011-02-18 17:03:39
个人认为之所以从基因内部设计引物扩增比较小的片段,那对引物的设计不是随便设计的,应该特异性非常好,尽可能不会出现非特异性扩增,这样的鉴定才有意义。之后之所以做克隆,测序,是因为拿到序列最有说服力。
另外,选择扩增比较小的片段,克隆的时候效率会高很多,而且测序只需要一个反应,这样成本也降低很多。
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2011-02-18 09:03:24
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