24小时热门版块排行榜    

申请当版主 | 存档区 |应助排行|模拟EPI排行 小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 订阅

管理团队 (金币库 69389.8 充值 )

主管区长：
月只蓝小红豆
主管版主：
abinitio沙漠猎人

杰出贡献者

专家顾问：
pigrassoxox6085lsloneilbrucefanjerkwin
荣誉版主：
wuli8lei0736nono2009fegg7502ghcacjzzy870720zuuv2010御剑江湖yjcmwgkjiaoyixiongcenwanglaiben_ladengljw4010
荣誉成员：
余泽成
14520105/146首页上一页103104105106107108下一页
全部 专家会诊 MS LAMMPS/DL_POLY Gromacs/Amber/NAMD DS/Sybyl/Autodock Monte Carlo ME/Gulp Hyperchem CPMD/CP2K 资源 其他 版务
回帖排序 发表排序 刷新页面  |  交流  |  求助  |  资源精华区 作者 最后发表
[热点] 拟解决的关键科学问题还要不要写 xps5000 2026-01-19 刚刚
[Monte C ] [已完结]sorption模块 fugacity和pressure?? (2/513) linbin1990 2013-10-28 2013-10-29 11:11:39 by 原来是梦8804
[MS] [已完结]MS 密度曲线 (4/1839) tim562944200 2013-10-21 2013-10-29 10:06:07 by tim562944200
[Gromacs ] [已完结]有没有研究淀粉方面分子动力学的大牛啊、本人菜鸟太多问题、需要帮助啊！！！    ( 1 2 ) (11/1725) 三木713 2013-10-24 2013-10-29 09:29:58 by 阿德
[Gromacs ] [已完结]gromacs中金属离子的处理 (6/2725) qingtian510 2013-09-23 2013-10-29 09:05:47 by 泊小夏
[Gromacs ] [已完结]使用amber中的antechamber 出现1 is not a valid atom id in CONECT (0/240) 达夫 2013-10-28 2013-10-28 21:59:55 by 达夫
[资源] [已完结]急求文献一篇。非常感谢。 (1/412) gliu5 2013-10-27 2013-10-27 23:09:56 by fangsteel
[Monte C ] [已完结]simbad/simspud 溅射模拟 (评阅+1) (0/419) ssjjleo 2013-10-27 2013-10-27 20:45:57 by ssjjleo
[Gromacs ] [已完结]蛋白质的电荷不为整数问题 (3/1850) 邓芳 2013-10-25 2013-10-27 16:27:43 by fangsteel
[CPMD/CP ] [已完结]关于cp2K软件的使用 (0/4998) weinazh 2013-10-27 2013-10-27 16:12:06 by weinazh
[Gromacs ] [已完结]contact angle time line 接触角与时间的关系 (1/430) jackwangee 2013-10-25 2013-10-26 15:16:05 by 王苗kevin
[Gromacs ] [已完结]跑出盒子的原子怎么移回来 (3/1564) shabeir 2013-10-25 2013-10-26 10:15:59 by fhh2626
[Gromacs ] [已完结]水溶菌酶模拟 (2/353) 水儿CoCo 2013-10-26 2013-10-26 09:46:10 by 水儿CoCo
[MS] [已完结]新手如何学习计算化学与分子模拟 (1/708) 城中木 2013-10-25 2013-10-25 20:48:46 by youyno
[Gromacs ] [已完结]求助VMD里面水的表示。。或者存储rst7的格式。。。 (4/953) 亍寞 2013-10-25 2013-10-25 15:00:16 by 亍寞
[MS] [已完结]ms画图求助，急急急 (1/381) 韩欢欢 2013-10-25 2013-10-25 14:18:00 by pigrass
[LAMMPS/ ] [已完结]求助：lammps怎么输出每一步的能量？ (2/3384) 暖雨 2013-10-22 2013-10-24 11:26:41 by botar
[DS/Syby ] [已完结]AutoDock大分子问题    ( 1 2 ) (11/2275) 625915317 2013-10-18 2013-10-24 10:56:16 by sjputao
[Monte C ] [已完结]大家谁有这篇英文文献，我们学校的资源搜不到，谢谢了 (6/1214) qinjianfa 2013-10-21 2013-10-24 10:13:56 by 孤独中生存
[LAMMPS/ ] [已完结]c++小白求助 (3/492) 韩欢欢 2013-10-20 2013-10-24 07:33:24 by lsloneil
[DS/Syby ] [已完结]怎样以Ref RMS来评价autodock对接方法的可靠性（重对接法） (2/3302) szhshuan 2013-10-22 2013-10-23 19:24:10 by monsoncupid
[MS] [已完结]水分子模型的设置问题 (0/464) magaohong 2013-10-23 2013-10-23 16:59:41 by magaohong
[Gromacs ] [已完结]跑动力学时停电，就跑了一大半，能不能在继续做啊    ( 1 2 ) (15/2152) 1054950560 2013-10-22 2013-10-23 16:46:03 by 1054950560
[DS/Syby ] [已完结]DS分子对接怎么评价？ (3/1797) 天湖酒 2013-09-11 2013-10-23 15:51:36 by monsoncupid
[ME/Gulp] [已完结]ME对同一个模型，每次的relaxation操作都引起结果的变化，为什么？ (1/442) 0712002160 2013-05-27 2013-10-23 06:21:11 by 王心凌wf
[DS/Syby ] [已完结]我在sybyl里导入活性数据的时候，总有问号错误出现 (0/323) 565034654 2013-10-22 2013-10-22 17:31:38 by 565034654
[MS] [已完结]谁能帮我画一个钕铁硼（Nd2Fe14B）晶体单胞结构图啊？谢谢 (1/1845) ccmm2008 2013-10-21 2013-10-22 16:52:57 by pigrass
[MS] [已完结]ms 6.1安装求助 (2/472) chenfeng2007 2013-10-22 2013-10-22 16:40:32 by chenfeng2007
[Monte C ] [已完结]初用MUSIC,请问分子文件从哪里能找得到？例如MIL-53    ( 1 2 ) (10/1344) rdfce6 2013-08-01 2013-10-22 11:43:17 by m11111222222
[MS] [已完结]DS2.5问题求助 (4/1523) 张学升 2013-10-10 2013-10-22 09:54:07 by yaozhq
[MS] [已完结]sorption模块中，逸度和压力有什么区别 (2/950) linbin1990 2013-10-20 2013-10-22 08:36:06 by linbin1990
[Gromacs ] [已完结]amber跑动力学后如何分析二级结构的变化 (0/666) 1054950560 2013-10-21 2013-10-21 15:43:25 by 1054950560
[Monte C ] [已完结]蒙特卡罗法模拟玻璃固化体的浸出率 (0/491) qinjianfa 2013-10-21 2013-10-21 14:28:55 by qinjianfa
[MS] [已完结]MS软件运行过程中，计算机断电，重新开机后可否继续运行？如何操作？ (4/1153) dsdragon0546 2013-10-19 2013-10-21 09:06:49 by dragon_d
[MS] [已完结]MIL68上手动添加了H原子，然后用forcite优化 (1/490) linbin1990 2013-10-20 2013-10-20 22:53:16 by Voland
[DS/Syby ] [已完结]有离子的化合物如何对接 (0/454) zhouzhiguang 2013-10-19 2013-10-19 20:56:23 by zhouzhiguang
[专家会诊] [已完结][关贴]lammps跨节点安装合适吗？ (7/2052) 1612 2013-10-17 2013-10-19 20:20:37 by 1612
[MS] [已完结]水分子的模拟 (2/663) magaohong 2013-10-17 2013-10-19 19:59:51 by dsdragon0546
[Gromacs ] [已完结][关贴]SiO2的模型-gromacs (0/1204) polyester 2013-10-19 2013-10-19 16:03:10 by polyester
[MS] [已完结]请问这样的结构图用什么软件画 (2/924) honeyduck 2013-10-18 2013-10-18 23:19:43 by honeyduck
[其他] [已完结]催化反应，其中一个反应物添加多会造成反应速率降低是什么原因 (2/420) mln2007 2013-10-15 2013-10-18 17:42:56 by mln2007
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps 如何让原子以某种速度（函数）移动？ (0/3133) 树栽子047 2013-10-18 2013-10-18 16:33:05 by 树栽子047
[其他] [已完结]autodock 模拟结果不对 (5/776) huantao12 2013-10-10 2013-10-18 16:10:01 by 药物设计
[ME/Gulp] [已完结].xtd和.xcd文件的问题 (4/1698) sd-wmg 2013-10-17 2013-10-18 15:30:15 by pigrass
[MS] [已完结]金属团簇沉积过程模拟可以用MS实现吗？ (5/917) walkhf 2013-10-11 2013-10-18 11:39:13 by voleyes
[资源] [已完结]求amber9.tgz (2/432) euroford 2013-10-15 2013-10-18 10:22:33 by euroford
[Gromacs ] [已完结]GROMACS做二维多孔石墨烯的MD，求一合适的nvt.mdp参数文件 (1/1095) Physics77 2013-10-16 2013-10-17 21:38:31 by fangsteel
[专家会诊] [已完结]做虚拟筛选判断一个化合物好坏的标准是什么 (6/1738) piscesee 2013-10-14 2013-10-17 18:25:04 by huyingdamon
[DS/Syby ] [已完结]AutoDock安装问题 (5/1346) xiaodaolai 2013-10-13 2013-10-17 12:44:31 by xiaodaolai
[MS] [已完结]构建晶体结构，这其中P是什么意思啊 (0/1072) Lzp425496024 2013-10-17 2013-10-17 10:12:53 by Lzp425496024
[MS] [已完结]用以描述碳硫和碳氧的势函数 (0/340) songyunsu 2013-10-17 2013-10-17 09:13:19 by songyunsu
[LAMMPS/ ] [已完结]Ubuntu 编译Lammps 单机串行错误，帮帮忙 (评阅+1) (5/2122) shixha 2011-04-23 2013-10-17 07:24:19 by aihehaitang
[Gromacs ] [已完结]Gromacs跑完动力学模拟之后如何分析小分子和蛋白之间的相互作用？ (2/1251) pkuchemistry 2013-10-15 2013-10-16 20:28:18 by 转基因猴子
[Gromacs ] [已完结]跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容，为什么？ (4/1930) pkuchemistry 2013-10-16 2013-10-16 19:03:25 by pkuchemistry
[LAMMPS/ ] [已完结]能够使用LJ势来模拟水吗 (4/934) chenjingzhi 2013-10-14 2013-10-16 14:24:43 by chenjingzhi
[其他] [已完结]PyRx中怎样添加Si的原子类型 (0/384) 邓芳 2013-10-16 2013-10-16 11:36:23 by 邓芳
[DS/Syby ] [已完结]我是初学小菜鸟， 请教版内高手有什么杂志常收录相关docking的文件，比较权威的 (2/443) junjun0711 2013-10-15 2013-10-16 11:07:30 by junjun0711
[LAMMPS/ ] [已完结]除了写restart，lammps里还有其他方法保留group信息，以便继续计算吗？ (0/932) rush7 2013-10-16 2013-10-16 03:30:41 by rush7
[MS] [已完结]关于结构优化的问题 (0/893) 白发魔女 2013-10-15 2013-10-15 20:03:33 by 白发魔女
[MS] [已完结]MS无法导出任何格式的文件 (4/2333) rdfce6 2013-08-15 2013-10-15 17:51:26 by 奈落之夜
[DS/Syby ] [已完结]想请您指点一下如何在ds中安装UniRef90 database (0/331) ttrr1987 2013-10-15 2013-10-15 15:16:13 by ttrr1987
[MS] [已完结]forcite做动力学计算出错了，哪位帮忙看一下是什么原因    ( 1 2 ) (11/5014) longwei1221 2012-10-23 2013-10-15 11:36:17 by longweig
[MS] [已完结]关于MS动力学精度设置问题 (4/1548) cg陈 2013-10-13 2013-10-15 08:34:08 by siyecao0425
[MS] [已完结]做为研一新生，面对实验课题我很迷茫！    ( 1 2 ) (13/1526) 小小鑫000 2013-09-23 2013-10-15 00:12:59 by Voland
[MS] [已完结]materials studio里哪个模块可以模拟多孔聚合物（有机无机复合且带电荷）？ (1/786) 水流星章 2013-10-14 2013-10-14 21:40:26 by 水流星章
[MS] [已完结]GULP如何加bond order parameters (0/329) huxiao.gl 2013-10-14 2013-10-14 20:21:59 by huxiao.gl
[DS/Syby ] [已完结]请问大家这种图片里面的棍状蛋白是用哪个命令做出来的？ (2/305) wohaihao 2013-10-10 2013-10-14 18:22:17 by wohaihao
[MS] [已完结]求助MS6.0中如何营造这种吸附环境 (1/536) huachao90 2013-10-04 2013-10-14 16:28:35 by pfabc0826
[MS] [已完结]求助：怎样学好MS与DMol3 (0/404) 追梦钟0214 2013-10-14 2013-10-14 15:27:49 by 追梦钟0214
[MS] [已完结]构建自由基模型 (4/2183) ytduh 2013-10-14 2013-10-14 14:01:41 by pigrass
[其他] [已完结]求助 石墨烯尺寸问题 (0/352) J_destiny___ 2013-10-14 2013-10-14 10:27:44 by J_destiny___
[DS/Syby ] [已完结]安装DS2.5后运行有问题 (2/369) evelyn_w 2013-09-11 2013-10-14 10:25:15 by monsoncupid
[DS/Syby ] [已完结]求 SYBYL1.1.083软件（包括license文件），感激不尽。 (4/2100) 912941425 2013-10-13 2013-10-14 00:20:58 by cao2oem
[其他] [已完结]请问大家有什么软件可以做一个蛋白残基侧链的振动图 (3/689) pink877623 2013-10-11 2013-10-13 10:26:37 by tsingtaobeer
[MS] [已完结]MS软件打开时出现问题 (0/291) 初之 2013-10-13 2013-10-13 09:03:20 by 初之
[专家会诊] [已完结]sybyl对接时，用CHEMDRAW格式画的分子如何保存为SYBYL识别的格式啊 (2/2465) 哀兵必胜 2013-05-06 2013-10-13 07:38:29 by tsingtaobeer
[Gromacs ] [已完结]有葡萄糖的par和top文件吗 (2/489) wshzxcc 2012-04-20 2013-10-12 18:00:32 by 29050801
[MS] [已完结]一价铜离子的L-J势能参数是多少？请有知道的大神能说一下。 (0/412) wofjg2008 2013-10-12 2013-10-12 15:28:56 by wofjg2008
[DS/Syby ] [已完结]autodock4 can't create log file C:\Program Files\MGLTools 1.5.4\WORK\p?.dlg (6/999) veradpp 2012-07-25 2013-10-12 11:49:36 by veradpp
[其他] [已完结]求助MOE2012 (4/494) hoc2h2 2013-10-10 2013-10-12 00:18:11 by forpal
[MS] [已完结]Autodock安装问题 (3/830) autumns3 2013-10-08 2013-10-11 19:20:54 by longytu
[其他] [已完结]求助 Cu Ni合金势函数 要做合金的分子动力学模拟，势函数找不到啊 (2/408) liandarupen 2013-10-09 2013-10-11 11:21:23 by liandarupen
[其他] [已完结]flip ring corner如何解释呢？ (0/433) jinyurui 2013-10-11 2013-10-11 10:38:35 by jinyurui
[MS] [已完结]MS连续模拟降温过程 (2/600) 杰克斯派洛王 2013-10-10 2013-10-10 22:10:40 by walkhf
[LAMMPS/ ] [已完结]分子散开为原子 (1/417) jane8556 2013-10-10 2013-10-10 22:02:47 by fangsteel
[其他] [已完结]有个基因优化的网址这么打不开 (0/239) 史前五百年 2013-10-10 2013-10-10 21:47:53 by 史前五百年
[其他] [已完结]MOPAC问题 (6/767) chengh0656 2012-10-09 2013-10-10 20:37:37 by qdykswang
[MS] [已完结]求教如何在amorphous cell 中加入周期性结构 (0/335) pp123321 2013-10-10 2013-10-10 19:13:53 by pp123321
[DS/Syby ] [已完结]sybyl-x 1.2 水分子介导的氢键怎么显示出来？ (2/647) 胡成海 2013-10-06 2013-10-10 16:39:26 by s1g2k3
[专家会诊] [已完结]pdb文件显示 (5/718) little_lion 2013-06-28 2013-10-10 11:55:36 by fengxinzi78
[DS/Syby ] [已完结]NAD和底物分子 两个配体怎么dock进一个蛋白质里？ (4/834) 835598372 2013-10-08 2013-10-10 10:00:44 by yaozhq
[MS] [已完结]MS的Doml模块计算结果错误 (6/1330) 白发魔女 2013-09-29 2013-10-10 09:33:44 by Lzp425496024
[MS] [已完结]有朋友有3Dmax 7.0英文版软件吗？很急需，O(∩_∩)O谢谢啦 (0/387) lanyue123 2013-10-10 2013-10-10 09:30:44 by lanyue123
[LAMMPS/ ] [已完结]声子态密度求助 (1/769) cumtlibt 2013-10-09 2013-10-09 18:52:16 by cumtlibt
[MS] [已完结]金属Cu升温熔化结晶模拟，就是从2.5K加热到2000K，fix 综系哪里总有错误，求大神改下 (2/705) 534895182 2013-03-27 2013-10-09 18:51:05 by mali988920
[MS] [已完结]请问MS如何单独显示一大堆分子中指定的某一个分子？谢谢！ (5/1460) 1612 2013-10-08 2013-10-09 17:22:24 by 1612
[MS] [已完结]layer builder (0/186) missingwudi 2013-10-09 2013-10-09 17:10:22 by missingwudi
[MS] [已完结]关于分子描述符 (4/3137) bemy1004 2013-10-03 2013-10-09 16:17:49 by zlp-lw
[其他] [已完结]求画图 (0/205) qianlover 2013-10-09 2013-10-09 10:43:44 by qianlover
[LAMMPS/ ] [已完结]velocity ramp comand (2/850) honghaier90 2013-10-08 2013-10-09 09:13:51 by honghaier90
14520105/146首页上一页103104105106107108下一页
相关版块跳转
查看