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piscesee铁杆木虫 (正式写手)
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做虚拟筛选判断一个化合物好坏的标准是什么
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各位，做虚拟筛选时怎么判断一个小分子化合物是筛选得到的有可能合理的化合物，单从binding energy就可以么，个人觉得由于分子结构差别很大，不同分子含有的原子个数差别很大，看最后得到的总的binding energy不能反应问题啊。。。 我试了下，将已经上市的原子数较少的药物分子跟一个比它原子数多的随机的新化合物比较，对接后这个药物分子的binding energy绝对值反而会比新化合物小啊，这是怎么回事，应该不是操作问题。难道这个新化合物会有更好的活性，我觉得不太可能。。。 所以虚拟筛选怎么去判断该合成哪些化合物来提高成功率呢。。。 |
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