应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 做虚拟筛选判断一个化合物好坏的标准是什么
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知（长期有效）
51/1返回列表
查看: 1689  |  回复: 6
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

piscesee

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 做虚拟筛选判断一个化合物好坏的标准是什么

各位，做虚拟筛选时怎么判断一个小分子化合物是筛选得到的有可能合理的化合物，单从binding energy就可以么，个人觉得由于分子结构差别很大，不同分子含有的原子个数差别很大，看最后得到的总的binding energy不能反应问题啊。。。
我试了下，将已经上市的原子数较少的药物分子跟一个比它原子数多的随机的新化合物比较，对接后这个药物分子的binding energy绝对值反而会比新化合物小啊，这是怎么回事，应该不是操作问题。难道这个新化合物会有更好的活性，我觉得不太可能。。。
所以虚拟筛选怎么去判断该合成哪些化合物来提高成功率呢。。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2013-10-14 16:18:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个问题要是能完美解决，就是药物研发的重大突破了
赞一下 回复此楼
4楼2013-10-16 10:04:00
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
虚拟筛选的binging energy都是简化的打分函数 估算的非常不准确的 除非很相似的分子 否则比较能量很难比出什么来
赞一下 回复此楼
2楼2013-10-15 10:05:45
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piscesee

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yaozhq at 2013-10-15 10:05:45
虚拟筛选的binging energy都是简化的打分函数 估算的非常不准确的 除非很相似的分子 否则比较能量很难比出什么来

那怎么判断筛选出来的分子哪个好哪个不好呢
赞一下 回复此楼
3楼2013-10-15 16:39:29
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huyingdamon

银虫 (小有名气)
请问您是用的什么软件筛选的 是筛选的小分子吧 我用的gromacs 做的不是药物筛选 是基于模板分子A 从几个其他分子中筛选跟A作用最强的功能单体分子B 有些问题始终解决不了 希望能请教您 感激涕零！！！！！
赞一下 回复此楼
5楼2013-10-17 16:36:59
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭