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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 虚拟筛选的化合物没有活性，还能干嘛，谢谢
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)

[求助] 虚拟筛选的化合物没有活性，还能干嘛，谢谢 已有1人参与

大家好，前段时间虚拟筛选了ZINC数据库并且从SPEC买了化合物，经过细胞筛选，很可惜，没有活性，请问这样还能发个文章吗？中英文即可，有这样的刊物或是例文吗
或者能干点什么？
耗时 耗力 耗钱干得工作就这样打水漂了吗？谢谢！
有经验的虫友，请指点一二，不胜感激！
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1楼 2013-07-21 16:28:54
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)
2楼2013-07-23 20:27:02
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lrf1980

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-07-24 17:01:13
啄木鸟NO.1: 金币+5, 谢谢，先给这些，看看还有好的回复吗 2013-07-27 19:50:03
试试看买一下蛋白，然后看看化合物对蛋白质是否有结合作用，如果有，可能是小分子无法进入细胞，或者是小分子可能对其它的细胞内蛋白也有结合作用。对接并不能告诉你是否有细胞活性。对接最多告诉你的就是在不考虑溶剂的条件下，化合物对蛋白质的结合到底有多大的可能性。
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3楼2013-07-24 07:20:52
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
酶活性测了么？？酶活性还行的话也可以。
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
4楼2013-07-24 15:23:59
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lrf1980 at 2013-07-24 07:20:52
试试看买一下蛋白，然后看看化合物对蛋白质是否有结合作用，如果有，可能是小分子无法进入细胞，或者是小分子可能对其它的细胞内蛋白也有结合作用。对接并不能告诉你是否有细胞活性。对接最多告诉你的就是在不考虑溶 ...

谢谢！ 酶试剂盒很贵，我们都是挑一两个细胞活性好的做做酶活，现在是头一回虚拟筛选，得到20-30化合物，结构差异很大，该选哪个测酶活呢，要是都测的话，造价太高，领导可能不通过
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5楼2013-07-24 18:59:41
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ts2009 at 2013-07-24 15:23:59
酶活性测了么？？酶活性还行的话也可以。

谢谢！ 酶试剂盒很贵，我们都是挑一两个细胞活性好的做做酶活，现在是头一回虚拟筛选，得到20-30化合物，结构差异很大，该选哪个测酶活呢，要是都测的话，造价太高，领导可能不通过
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6楼2013-07-24 18:59:55
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
啄木鸟NO.1: 金币+5, 谢谢 2013-07-27 19:50:17
引用回帖:
6楼: Originally posted by 啄木鸟NO.1 at 2013-07-24 18:59:55
谢谢！ 酶试剂盒很贵，我们都是挑一两个细胞活性好的做做酶活，现在是头一回虚拟筛选，得到20-30化合物，结构差异很大，该选哪个测酶活呢，要是都测的话，造价太高，领导可能不通过...

这个就不好说了，关键现在的细胞实验没什么活性，如果再不能测测酶的活性就很困难了。20-30个化合物也不是很贵的吧，老板这点钱都不想投入的话，你只能和他说就做纯的计算得了。想发好的Paper又想成本最小，怎么可能？？
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
7楼2013-07-27 14:31:55
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fanc232

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

如果能通过计算模拟再重点解释一下为什么这些化合物没有活性，能找到依据分析一下这些化合物和已知药的区别，那你就牛了。。。。。。
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我很喜欢计算机辅助药物设计
8楼2014-12-22 13:51:30
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dengxuejiao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by fanc232 at 2014-12-22 13:51:30
如果能通过计算模拟再重点解释一下为什么这些化合物没有活性，能找到依据分析一下这些化合物和已知药的区别，那你就牛了。。。。。。

想法不错
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9楼2015-09-01 21:02:53
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zdf1021

木虫 (正式写手)

药学人生
请问楼主，ZINC数据库里的化合物你是怎么买到的，我也在做虚筛工作，筛出来的化合物不知道怎么买，谢谢了
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路漫漫其修远兮，吾将上下而求索。
10楼2017-08-23 08:50:01
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