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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)

[求助] 虚拟筛选的化合物没有活性,还能干嘛,谢谢 已有1人参与

大家好,前段时间虚拟筛选了ZINC数据库并且从SPEC买了化合物,经过细胞筛选,很可惜,没有活性,请问这样还能发个文章吗?中英文即可,有这样的刊物或是例文吗
或者能干点什么?
耗时 耗力 耗钱干得工作就这样打水漂了吗?谢谢!
有经验的虫友,请指点一二,不胜感激!
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)

2楼2013-07-23 20:27:02
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lrf1980

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-07-24 17:01:13
啄木鸟NO.1: 金币+5, 谢谢,先给这些,看看还有好的回复吗 2013-07-27 19:50:03
试试看买一下蛋白,然后看看化合物对蛋白质是否有结合作用,如果有,可能是小分子无法进入细胞,或者是小分子可能对其它的细胞内蛋白也有结合作用。对接并不能告诉你是否有细胞活性。对接最多告诉你的就是在不考虑溶剂的条件下,化合物对蛋白质的结合到底有多大的可能性。
3楼2013-07-24 07:20:52
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
酶活性测了么??酶活性还行的话也可以。
√:寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
4楼2013-07-24 15:23:59
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lrf1980 at 2013-07-24 07:20:52
试试看买一下蛋白,然后看看化合物对蛋白质是否有结合作用,如果有,可能是小分子无法进入细胞,或者是小分子可能对其它的细胞内蛋白也有结合作用。对接并不能告诉你是否有细胞活性。对接最多告诉你的就是在不考虑溶 ...

谢谢! 酶试剂盒很贵,我们都是挑一两个细胞活性好的做做酶活,现在是头一回虚拟筛选,得到20-30化合物,结构差异很大,该选哪个测酶活呢,要是都测的话,造价太高,领导可能不通过
5楼2013-07-24 18:59:41
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啄木鸟NO.1

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ts2009 at 2013-07-24 15:23:59
酶活性测了么??酶活性还行的话也可以。

谢谢! 酶试剂盒很贵,我们都是挑一两个细胞活性好的做做酶活,现在是头一回虚拟筛选,得到20-30化合物,结构差异很大,该选哪个测酶活呢,要是都测的话,造价太高,领导可能不通过
6楼2013-07-24 18:59:55
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
啄木鸟NO.1: 金币+5, 谢谢 2013-07-27 19:50:17
引用回帖:
6楼: Originally posted by 啄木鸟NO.1 at 2013-07-24 18:59:55
谢谢! 酶试剂盒很贵,我们都是挑一两个细胞活性好的做做酶活,现在是头一回虚拟筛选,得到20-30化合物,结构差异很大,该选哪个测酶活呢,要是都测的话,造价太高,领导可能不通过...

这个就不好说了,关键现在的细胞实验没什么活性,如果再不能测测酶的活性就很困难了。20-30个化合物也不是很贵的吧,老板这点钱都不想投入的话,你只能和他说就做纯的计算得了。想发好的Paper又想成本最小,怎么可能??
√:寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
7楼2013-07-27 14:31:55
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fanc232

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

如果能通过计算模拟再重点解释一下为什么这些化合物没有活性,能找到依据分析一下这些化合物和已知药的区别,那你就牛了。。。。。。
我很喜欢计算机辅助药物设计
8楼2014-12-22 13:51:30
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dengxuejiao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by fanc232 at 2014-12-22 13:51:30
如果能通过计算模拟再重点解释一下为什么这些化合物没有活性,能找到依据分析一下这些化合物和已知药的区别,那你就牛了。。。。。。

想法不错
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9楼2015-09-01 21:02:53
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zdf1021

木虫 (正式写手)

药学人生

请问楼主,ZINC数据库里的化合物你是怎么买到的,我也在做虚筛工作,筛出来的化合物不知道怎么买,谢谢了
路漫漫其修远兮,吾将上下而求索。
10楼2017-08-23 08:50:01
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