应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 用已建立好的3D-QSAR模型预测虚拟筛选得到的化合物，预测值都一样
101/1返回列表
查看: 1654  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

顽灵

新虫 (初入文坛)

[求助] 用已建立好的3D-QSAR模型预测虚拟筛选得到的化合物，预测值都一样

请教各位，我用已经建立好的3D-QSAR CoMFA模型（q2=0.428，r2=0.815），虽然结果也不是很好，但我用这个模型去预测用药效团虚拟筛选的到的化合物是，得到的活性值在1.423-1.425之间，（训练集活性值从0.x到2），试过很多其他模型，也有同样的问题，预测值都基本一致。
而我用别的类型的分子建立的模型预测结果就很正常，预测值从高到底。
请教各位童鞋，这会是什么原因造成的呢？谢谢啦！
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

woyaopaocheo

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-08-30 16:17:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woyaopaocheo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-08-31 08:47:12
comfa有一个必须条件，就是你的化合物母核要一致，你化合物多样性么？
赞一下 回复此楼
2楼2012-08-31 08:38:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

顽灵

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by woyaopaocheo at 2012-08-31 08:38:48
comfa有一个必须条件，就是你的化合物母核要一致，你化合物多样性么？

母核都是一致的呀，两个苯环用一个linker相连接，对苯环进行修饰的。
赞一下 回复此楼
3楼2012-08-31 09:31:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woyaopaocheo

金虫 (小有名气)
你化合物的构像是如何得到的？
赞一下 回复此楼
4楼2012-08-31 10:04:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

顽灵

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by woyaopaocheo at 2012-08-31 10:04:01
你化合物的构像是如何得到的？

用药效团虚拟筛选得到的
赞一下 回复此楼
5楼2012-08-31 10:43:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woyaopaocheo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-01 16:19:28
顽灵: 金币+8, ★★★很有帮助 2012-09-03 10:59:26
3D QSAR对于构想要求非常重要，虚拟筛选得到的构象我认为不是很好，你可以用其他软件，比如corina之类国际比较认可的构象转换
赞一下 回复此楼
6楼2012-09-01 13:21:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aqiao

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
顽灵: 金币+2, ★有帮助 2012-09-03 10:59:33
q2小于0.5模型不好，要重建。
赞一下 回复此楼
7楼2012-09-01 18:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

顽灵

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by woyaopaocheo at 2012-09-01 13:21:45
3D QSAR对于构想要求非常重要，虚拟筛选得到的构象我认为不是很好，你可以用其他软件，比如corina之类国际比较认可的构象转换

恩，谢谢拉～
是不是因为虚拟筛选得到的结构跟建立模型是所用的结构差别较大，这样不适合与活性预测呢？
赞一下 回复此楼
8楼2012-09-03 10:56:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

顽灵

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by aqiao at 2012-09-01 18:34:55
q2小于0.5模型不好，要重建。

我看文献中也有q2小于0.5的。。。
那一般q2要达到多少才可以呀？我试了很多，q2都没有大于0.5的。。
赞一下 回复此楼
9楼2012-09-03 10:57:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woyaopaocheo

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
对，虚拟筛选得到的构象很随机，没有国际认可度，最好用专业软件转一下再去做QSAR
赞一下 回复此楼
10楼2012-09-03 17:30:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 顽灵 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 304求调剂 +4 素年祭语 2026-03-15 4/200 2026-03-16 09:42 by 闲人终南山
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 327求调剂 +4 Ffff03 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:17 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +9 Copy267 2026-03-10 9/450 2026-03-13 23:45 by userper
[考研] 0703化学调剂 +4 快乐的香蕉 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +5 邱gl 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:37 by JourneyLucky
[考研] 求调剂（材料与化工327） +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[考研] 【考研调剂求收留】 +3 Ceciilia 2026-03-11 3/150 2026-03-13 20:18 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 283求调剂，材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭