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SDAUWY

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子新手,PCR产物回收浓度太低,请教各位虫友! 已有6人参与

本人刚开始接触分子方面的试验,准备做RNA干扰,目前正用带T7的引物跑PCR,产物带挺亮,然后用天根的试剂盒切胶回收的浓度太低,一般都在30ng/μl左右。我后续要用这个回收产物做模板走promega T7BiboMAX Express RNAi System 这个试剂盒的程序,要求模板量在1 μg,但我的回收产物远不够这个量,请教各位虫友怎么提高回收产物的量,或者有做过这个的我想请教下整个过程,非常感谢!
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表弟爱网游

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
SDAUWY(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-06-19 20:41:31
扩PCR多扩几管,电泳鉴定的时候,跟MARKER比对一下,粗略算下浓度。回收的时候,就按正常的步骤回收,但是最后加水溶解的时候,一定记得水滴在回收柱子的膜上面,一般20ul够了。比如你扩了3份,第一个柱子用20ul溶解后,这20ul再加到第二份的柱子膜上面,再溶一次,然后再溶第三个柱子,浓度会提的很高,灰常亮切记水一定要滴到膜上面,否则回收产物溶不下来。
当一切如飞舞的落叶坠落,惋惜之余,也要学会原谅与释怀
6楼2015-06-19 11:03:54
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-06-19 20:41:45
我之前做过RNAi实验,刚开始也和你一样,DNA模板浓度低上不去,没法合成RNA,后来试了很多种方法,给你介绍一下:
1、如上面虫友所说,多做几个PCR重复,我50uL反应体系做了5个重复,最后会收到一起,20uL水依次洗脱5个柱子,最后浓度能达到200到300之间;
2、也是多做几次PCR重复,最后将所有PCR产物混合在一起,加入2倍体积无水乙醇和1/10体积醋酸钠,充分混匀后放在-20℃冰箱半个小时以上,之后以离心机最大转速(12000rpm以上)离心15min,再用75%乙醇洗涤,同样采用最大转速离心,最后加20uL水溶解即可,取其中1uL电泳检测。此法回收产物可能含有杂质,但只要没有非特异性扩增而且引物二聚体较少即可,此法回收效率比试剂盒高很多,可以一试
没有做不到,只有想不到!
8楼2015-06-19 20:37:43
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普通回帖

博克侬浮码

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
SDAUWY(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-19 20:41:09
多扩几管PCR,在回收过柱子的时候把离心后的液体再过一遍柱子,洗脱时也是,洗脱两次,加的洗脱液量不要太大,我这样做回收的时候浓度在100-300ng/ul左右
2楼2015-06-18 10:36:19
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doudou_32

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
SDAUWY(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-19 20:41:17
如果你跑出来的带是单一一条带,可以试试PCR产物回收试剂盒,回收效率会高一些。
3楼2015-06-18 11:03:24
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SDAUWY

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 博克侬浮码 at 2015-06-18 10:36:19
多扩几管PCR,在回收过柱子的时候把离心后的液体再过一遍柱子,洗脱时也是,洗脱两次,加的洗脱液量不要太大,我这样做回收的时候浓度在100-300ng/ul左右

谢谢,我再试试,今天刚跑的PCR产物有500-600的浓度,按你的说法做做试试看能回收到多少
4楼2015-06-18 15:54:09
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yangjingjing

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
摇菌时间稍微增加;菌量加大回收;洗脱液少放点就好了
努力打败一切
5楼2015-06-19 10:35:02
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saiman131415

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
SDAUWY(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-19 20:41:39
试剂盒回收一般是不会出问题的,你的PCR产物长度要么短了,要么长了,胶水浴溶解后加1倍预冷异丙醇和5ul 3M 醋酸钠,冰浴后再过柱子
走别人的路让别人无路可走
7楼2015-06-19 14:52:49
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SDAUWY

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 王平阳 at 2015-06-19 20:37:43
我之前做过RNAi实验,刚开始也和你一样,DNA模板浓度低上不去,没法合成RNA,后来试了很多种方法,给你介绍一下:
1、如上面虫友所说,多做几个PCR重复,我50uL反应体系做了5个重复,最后会收到一起,20uL水依次洗 ...

谢谢!我准备试一下你的方法。不知道能否留下你的联系方式,还有很多问题想要求教!谢谢!
9楼2015-06-22 14:28:16
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wuwenmei

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 王平阳 at 2015-06-19 20:37:43
我之前做过RNAi实验,刚开始也和你一样,DNA模板浓度低上不去,没法合成RNA,后来试了很多种方法,给你介绍一下:
1、如上面虫友所说,多做几个PCR重复,我50uL反应体系做了5个重复,最后会收到一起,20uL水依次洗 ...

高手,赞一个,
下雨天就算没有伞,我也要学会努力奔跑!
10楼2015-06-22 17:57:17
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