24小时热门版块排行榜    

查看: 3267  |  回复: 14

weining1203

新虫 (小有名气)

[求助] rt-pcr电泳图,求好心虫友帮助分析一下,跪谢。。。

这是今天跑得rt-pcr图,最两边的的是DL2000marker,2-9号点样孔为温度梯度(45-60度),由于提的rna有dna污染,所以消化了一下。。。1号点样孔为没有经过dnase消化的rna,也没有经过反转录,当做对比。。。 目的条带约860bp左右,1号点样孔有明显目的条带,但也有杂带,模板应该是基因组dna,但2-9号几乎没有目的条带,我想问一下是不是反转录又问题啊,由于没有内参,所以不知道是不是反转录有问题。。。 还有植物里有没有通用的内参啊,比如18s,序列为多少啊,我做的油松,找不到内参基因,求大神指点啊。。。

rna



梯度pcr
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

免疫游侠

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-23 18:45:40
分析了一下你的结果,由于你的marker是跑出来了的,1号样本没有经过dnase消化也跑出来了,而2-9号样本是经过dnase消化而没有跑出来,因此可能是你在消化过程中DNA把RNA也给消化掉了,建议做预实验或是重做实验,再找原因,祝实验顺利!
吾尝终日而思不如须臾之所学!
2楼2012-04-23 12:25:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weining1203

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 免疫游侠 at 2012-04-23 12:25:12:
分析了一下你的结果,由于你的marker是跑出来了的,1号样本没有经过dnase消化也跑出来了,而2-9号样本是经过dnase消化而没有跑出来,因此可能是你在消化过程中DNA把RNA也给消化掉了,建议做预实验或是重做实验,再 ...

谢谢您的回答 啊。。。不是吧,1号样本没经过逆转录,所以模板应该是基因组dna。。。
3楼2012-04-23 16:59:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zgb1982

木虫 (正式写手)

不知道这个植物有没有全基因组序列啊,引物是怎么设的呢,产物中间没有加段内含子以区别基因组|DNA吗
4楼2012-04-23 22:27:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zgb1982

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励应助 2012-04-25 13:56:03
没有内参也确实不好说是不是cDNA的问题哦,是不是你DNA消化的时候没进行失活,把CDNA也消化了.不是说RNA也会扩出条带的吗
5楼2012-04-23 22:29:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

freerain

禁虫 (职业作家)


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励应助 2012-04-25 13:55:49
本帖内容被屏蔽

6楼2012-04-24 01:56:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weining1203

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by freerain at 2012-04-24 01:56:58:
消化DNA要买Rnase free的Dnase I,并添加Rnase抑制剂
否则在消化过程中DNA把RNA也给消化掉了

买的是Promega的RQ1 RNase-Free DNase,应该没问题吧
7楼2012-04-24 09:02:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wushuwei1104

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励应助 2012-04-25 13:55:08
还是设计个内参引物吧,我们也是做植物的,一般内参都选取植物(油松)的Actin或是NADPH基因,这些都是比较常见的内参基因!!
勤能补拙
9楼2012-04-24 10:09:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mamadexiao

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 恩,鼓励提供有价值的应助哦 2012-04-25 13:55:00
weining1203: 金币+5, 有帮助 2012-05-09 15:46:47
我是做动物的,不知道植物的,但是,首先,你要确定你的RNA反转的好不好,先做个内参,跑个25-30CYCLE
要是觉得提的RNA不好,可以跑个电泳看看
你加酶消化的时候,处理的东西包括水,都是无RNase的吧?
再说说你的电泳
你的1号样品,说明你的引物没有问题,提的也没啥问题,但是,你的引物条件需要优化,试试提高退火温度。
你的剩下的啥都没有P出来,有可能是你的模板的问题
最好还是做个内参吧,没内参,做啥都是个虚的,你不好确定你的东西到底好不好
10楼2012-04-24 21:02:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

weining1203

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zgb1982 at 2012-04-23 22:29:44:
没有内参也确实不好说是不是cDNA的问题哦,是不是你DNA消化的时候没进行失活,把CDNA也消化了.不是说RNA也会扩出条带的吗

已经进行酶的失活了
8楼2012-04-24 09:03:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 weining1203 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 v7Aev8ORQjin 2026-08-22 3/150 2026-08-23 20:58 by 0p9y1isJp2jM
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 4/200 2026-08-23 20:55 by 0p9y1isJp2jM
[基金申请] 让我中一个面上吧! +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 19:34 by lXgU0RvNTDC9
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 19:22 by lXgU0RvNTDC9
[公派出国] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 7/350 2026-08-23 19:10 by lXgU0RvNTDC9
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 5/250 2026-08-23 18:55 by lXgU0RvNTDC9
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
信息提示
请填处理意见