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如何比对出外显子和内含子已有2人参与
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各位大侠: 我做的这种植物基因组未知,我通过PCR获得了某个基因的cDNA序列和相应的DNA序列,请问用什么软件可以比对出哪部分是外显子和内含子。急,万分感谢。 PS:我用DNAman比对,只比出来了一段外显子,其他的都比对错位了。 |
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liuderong
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【答案】应助回帖
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bayu18(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-03-30 20:48:27
bayu18: 金币+4, ★★★很有帮助 2015-03-31 08:34:26
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| 有DNA和cDNA做blast就行了,http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=align2seq,这个网站有两个方框,把DNA和cDNA分别放到两个框里,顺序不论,然后点击blast应该就看到结果了。 |
2楼2015-03-30 20:23:48
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liuderong
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