应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 急求：分析外显子和内含子的软件??
91/1返回列表
查看: 5901  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

小海豚1987

新虫 (初入文坛)

[求助] 急求：分析外显子和内含子的软件?? 已有4人参与

急求：分析外显子和内含子的软件??  我做的是无脊椎动物，基因组信息还没有完全上传NCBI，在网上看到一些网站都不能用，选择物种的下拉菜单里都没有我们做的物种。不知道应该怎么分析啊？求各位大虾帮忙！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

生物信息学 代谢毒理细胞生物

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-04-26 15:02:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-04-26 23:55:56
小海豚1987: 金币+2, ★有帮助 2014-04-30 22:30:44
可以用GeneScan ，http://genes.mit.edu/GENESCAN.html
赞一下 回复此楼
2楼2014-04-26 22:27:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunflower019

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小海豚1987: 金币+2, ★有帮助 2014-04-30 22:34:36
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-15 21:53:48
http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2014-04-28 10:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oylb

禁言 (正式写手)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验！ 2014-07-15 21:53:53
本帖内容被屏蔽
4楼2014-04-28 11:51:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小海豚1987

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-04-26 22:27:24
可以用GeneScan ，http://genes.mit.edu/GENESCAN.html

这个我之前尝试过了，但是里面没有无脊椎动物的信息
赞一下 回复此楼
5楼2014-04-30 22:30:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-03 12:16:46
可能直接用实验方法更简单，分别用cDNA和基因组的DNA 做模板进行PCR，之后送去测序，cDNA 不包含的序列不就是内含子，如果需要小一些的片段，可以结合类似物种的同源基因的大致位点对于目的基因片段所在的DNA进行有限水解，电泳或者层析分离出最邻近目的基因的DNA片段，然后根据对应的目的基因片段的mRNA的序列（可以从 蛋白质产物序列反推）与含有该序列的DNA片段的序列比较即可知道内含子与外显子序列。
赞一下 回复此楼
6楼2014-07-03 11:16:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

FGENESH在线分析工具可以做无脊椎动物的基因预测，有不少生物的基因组可供选择：
http://linux1.softberry.com/berr ... ;amp;subgroup=gfind
不过在线版本有一定功能限制，而本地安装版是要收费的
赞一下 回复此楼
7楼2014-10-20 15:34:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

childchou

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

3楼正解，一直用的就是这个
赞一下 回复此楼
boomshakalaka
8楼2014-10-20 20:58:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bayu18

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-07-03 11:16:03
可能直接用实验方法更简单，分别用cDNA和基因组的DNA 做模板进行PCR，之后送去测序，cDNA 不包含的序列不就是内含子，如果需要小一些的片段，可以结合类似物种的同源基因的大致位点对于目的基因片段所在的DNA进行有 ...

您好，请问我已经利用PCR的方法获得了cDNA和DNA序列，那么我用什么软件可以比对出内含子和外显子呢？不能用眼直接找吧，基因太长了。多谢。
赞一下 回复此楼
9楼2015-03-30 16:39:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小海豚1987 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 3/150 2026-11-10 01:40 by FChKX8meu1ds
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-10 01:29 by FChKX8meu1ds
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”：确已离世，正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭