| 查看: 2643 | 回复: 7 | |||
| 本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | |||
mjzjily铜虫 (初入文坛)
|
[求助]
关于基因构建中开放阅读框架的若干问题
|
||
|
Sample Text 我刚接触分子生物学不久，现在做基因构建的实验设计。在阅读文献时，对开放阅读框架产生了一些疑问，请各路高手多多指导了： 1. 我看到一些原核生物基因的ORF，有一部分包含在目的基因的序列中，也有一部分甚至在该基因启动子保守序列的上游。因此，如果要获得ORF片段的话，我应该如何知道哪些片段序列是ORF？只靠预测软件吗？ 2. 在原核生物的基因构建时，是不是只要将获得的目的基因片段连入载体，就可以了？还需要考虑开放阅读框架吗？若只构建目的基因，不考虑ORF，会不会影响基因的表达？ 3. 此外，每个基因都有一个ORF吗？可以不含有ORF？Sample TextSample Text |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 【分子生物】EPI帖 |
» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有162人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 一个关于水稻基因图位克隆的问题诚挚恳求大牛解答
已经有35人回复
- 关于开放阅读框（ORF）的问题
已经有3人回复
- 关于用农杆菌侵染法获得转基因植物的几点问题
已经有17人回复
- 【求助/交流】关于开放阅读框（ORF）的一个问题
已经有14人回复
- 【求助/交流】关于基因扩增的问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】求助：关于基因敲除后对下游基因的影响相关问题？
已经有5人回复
- 【转帖】我国成功研究出世界首个药用植物基因组框架图
已经有8人回复
lxj341401
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 58
- 应助: 388 (硕士)
- 贵宾: 0.238
- 金币: 17138.7
- 红花: 43
- 帖子: 2251
- 在线: 712.4小时
- 虫号: 111074
- 注册: 2005-11-20
- 专业: 生物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, 专家考核, Good！辛苦~ 2012-04-08 16:56:03
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, 专家考核, Good！辛苦~ 2012-04-08 16:56:03
|
ORF（open reading frame，开放阅读框)是DNA上的一段碱基序列，由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子，该段碱基序列编码一个蛋白。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。 1、片段序列是否ORF，自己用眼睛看太辛苦，用软件预测方便快捷，很多生物软件都能预测的，也有在线预测工具。 2、在原核生物的基因构建时，要考虑开放阅读框架的，否则影响基因的表达，出现提前蛋白表达不准确或不能表达的情况。 3、每个结构基因都有相应的每个基因ORF，编码RNA的基因一般没有ORF。 |
2楼2012-04-08 11:19:05
mjzjily
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 86.6
- 散金: 15
- 帖子: 42
- 在线: 32.4小时
- 虫号: 1411114
- 注册: 2011-09-21
- 性别: GG
- 专业: 基因表达调控与表观遗传学
  谢谢指导了。还有对于ORF的长度，我也有些疑惑。我查了很多有关原核orf的资料。我的理解是这样的。您看看是否有错？1.全长ORF：是指只含有编码一个全长蛋白质的序列，也就是指我们平时从网上查到滴目的基因的序列（从起始密码到终止密码）。是这样吗？ 2.ORF：网上查到说，基因中的ORF包含并位于开始编码与终止编码之间。那就是说，ORF是完全包含在全长ORF（目的基因序列）中的吗？还是说，ORF中有一部分是目的基因序列，另一部分是目的基因上游的序列，包括启动子，甚至启动子更上游的序列？ 3.基因构建时，要如何考虑ORF的情况，以防止阅读框架的改变？如果只克隆全长orf，再连入表达载体，会不会有阅读框架改变的可能？还是说一定要把ORF区连同目的基因一起构建入表达载体才行？ 谢谢啦~~？ |
3楼2012-04-09 16:50:10
lxj341401
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 58
- 应助: 388 (硕士)
- 贵宾: 0.238
- 金币: 17138.7
- 红花: 43
- 帖子: 2251
- 在线: 712.4小时
- 虫号: 111074
- 注册: 2005-11-20
- 专业: 生物化学
4楼2012-04-09 19:20:31
mjzjily
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 86.6
- 散金: 15
- 帖子: 42
- 在线: 32.4小时
- 虫号: 1411114
- 注册: 2011-09-21
- 性别: GG
- 专业: 基因表达调控与表观遗传学
5楼2012-04-09 20:00:31
mjzjily
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 86.6
- 散金: 15
- 帖子: 42
- 在线: 32.4小时
- 虫号: 1411114
- 注册: 2011-09-21
- 性别: GG
- 专业: 基因表达调控与表观遗传学
6楼2012-04-09 20:03:16
lxj341401
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 58
- 应助: 388 (硕士)
- 贵宾: 0.238
- 金币: 17138.7
- 红花: 43
- 帖子: 2251
- 在线: 712.4小时
- 虫号: 111074
- 注册: 2005-11-20
- 专业: 生物化学
7楼2012-04-09 21:29:08
yangjianchen
铜虫 (小有名气)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 1402.5
- 散金: 25
- 红花: 3
- 帖子: 147
- 在线: 74.7小时
- 虫号: 1217206
- 注册: 2011-03-01
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
8楼2013-08-21 09:08:16
