24小时热门版块排行榜    

查看: 1864  |  回复: 4

zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】如何分析mRNA(包括3‘-和5’端非编码区)

rt,如能举例,可追金币,万分感谢


谢谢虫友帮助,祝大家双节快乐啊
回复此楼
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molecula

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+5):谢谢分享。 2010-09-24 06:09:20
zcqcau(金币+3):你说的内含子不是mRNA上的吧? 2010-09-24 23:34:32
你说的分析 是分析什么?
整个mRNA序列?   这个真是一个挑战

首先 你要使用PP5 DNASTAR oliga等或者更精密的软件分析正序列

然后找出5'帽子和3'尾巴   当然 加帽子和尾巴是在剪接后水平上的

如果之前的话  还包括的整个内含子序列

所以 我觉得你要根据具体情况具体分析

如果是剪接之前  那么 请分为三部分来分析第一部分是5'端,也就是启动子之前部分,启动子编码甲酰甲硫氨酸。之前还有一部分序列。在剪接过程中会被去掉,并在该部分加上帽子。这个具体是什么,我不知道。第二部分是外显子部分,外显子部分编码氨基酸。所以,你可以逐个分析。第三部分,是内含子部分。内含子会涉及到RNA干涉作用,尤其是mRNA水平上的干涉,与内含子关系无比紧密。

如果是剪接之后  我估计 我也不用废话了 只剩下cDNA了,还有什么可说的?
2楼2010-09-23 23:41:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by molecula at 2010-09-23 23:41:28:
你说的分析 是分析什么?
整个mRNA序列?   这个真是一个挑战

首先 你要使用PP5 DNASTAR oliga等或者更精密的软件分析正序列

然后找出5'帽子和3'尾巴   当然 加帽子和尾巴是在剪接后水平上的

如果之前的 ...

我想问的是譬如“:启动子分析啊,信号肽啊,二三级结构预测啊。。。等等等
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
3楼2010-09-24 23:35:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molecula

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by zcqcau at 2010-09-24 23:35:16:



我想问的是譬如“:启动子分析啊,信号肽啊,二三级结构预测啊。。。等等等

。。。。。。。。。。。。。。。。。

无语    你的阐述。。。。
4楼2010-09-25 00:43:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by molecula at 2010-09-25 00:43:15:

。。。。。。。。。。。。。。。。。

无语    你的阐述。。。。

为什么无语呢?
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
5楼2010-10-02 16:47:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zcqcau 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 请问有知道博士后面上专家评审什么时候结束的么? +9 since—2010 2024-06-27 10/500 2024-06-27 13:55 by songyuren
[硕博家园] 夏至,要不要硕博联谊 +7 我是王小帅 2024-06-21 10/500 2024-06-27 13:41 by 我是王小帅
[基金申请] 今年什么时候会评啊 +9 lancet0903 2024-06-24 9/450 2024-06-27 13:22 by yrzhu1984
[教师之家] 高校辞职,要求赔偿,这到底合不合理 +24 传动_海神 2024-06-23 36/1800 2024-06-27 11:26 by f1yfish
[论文投稿] 关于论文第一通讯作者的问题? +4 winsaint 2024-06-26 4/200 2024-06-27 11:12 by gancs7894
[有机交流] 大佬们,打的核磁氢谱与chemdraw预测的有偏差 +7 来了个 2024-06-26 7/350 2024-06-27 11:11 by wubiansiya
[基金申请] 省基金太难了 +8 aasahr 2024-06-26 8/400 2024-06-27 10:35 by 小狮子2010
[硕博家园] 联培博士文章第一单位署名问题交流~ +10 橙成成c 2024-06-23 23/1150 2024-06-27 10:11 by 橙成成c
[考博] 对象没有,还非常想读博,难以抉择 +28 pvrw0224 2024-06-23 52/2600 2024-06-26 20:22 by pvrw0224
[考研] 刚当完兵回来想考研 +7 五官在线 2024-06-23 18/900 2024-06-26 17:05 by 1158057902
[硕博家园] 博士该不该读? +8 L1009225316 2024-06-25 8/400 2024-06-26 16:26 by huixiong0627
[基金申请] 评审专家会不会很在意申请人的单位啊 +11 lancet0903 2024-06-24 13/650 2024-06-26 11:42 by 漠上藜梭
[有机交流] 过柱子,产品,杂质在是 pe:ea=100:1 也一起出来? +5 w256 2024-06-25 5/250 2024-06-26 09:31 by 小木木cc
[基金申请] 厅级项目出校却没中 +13 Iwould 2024-06-23 20/1000 2024-06-26 06:14 by foolishmani
[考博] 没读上博,好焦虑! +6 wangzhe_bs 2024-06-24 8/400 2024-06-25 21:15 by wangzhe_bs
[有机交流] 对苯乙烯磺酰氯的合成机理 25+3 该死的科研 2024-06-24 5/250 2024-06-25 17:30 by 王学士
[教师之家] 复旦夏同学退学理由说明,哪儿可以下载? +7 苏东坡二世 2024-06-21 8/400 2024-06-25 12:42 by 药嘿1233
[基金申请] 演员杨幂在核心期刊发表论文,中国广播电视学期刊 +9 babu2015 2024-06-22 12/600 2024-06-25 11:05 by 我是勇敢牛牛
[金属] 寻找钛合金热压缩代做 +4 liuyang358 2024-06-23 4/200 2024-06-24 13:50 by 搬砖狗不放弃
[论文投稿] OSA期刊审稿逾期 +3 Thomas_Squid 2024-06-22 3/150 2024-06-23 15:20 by wspglt
信息提示
请填处理意见