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zcqcau铁杆木虫 (著名写手)
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【求助/交流】如何分析mRNA（包括3‘-和5’端非编码区）
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reasonspare(金币+5):谢谢分享。 2010-09-24 06:09:20
zcqcau(金币+3):你说的内含子不是mRNA上的吧？ 2010-09-24 23:34:32
reasonspare(金币+5):谢谢分享。 2010-09-24 06:09:20
zcqcau(金币+3):你说的内含子不是mRNA上的吧？ 2010-09-24 23:34:32
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你说的分析 是分析什么？ 整个mRNA序列？ 这个真是一个挑战 首先 你要使用PP5 DNASTAR oliga等或者更精密的软件分析正序列 然后找出5'帽子和3'尾巴 当然 加帽子和尾巴是在剪接后水平上的 如果之前的话 还包括的整个内含子序列 所以 我觉得你要根据具体情况具体分析 如果是剪接之前 那么 请分为三部分来分析第一部分是5'端，也就是启动子之前部分，启动子编码甲酰甲硫氨酸。之前还有一部分序列。在剪接过程中会被去掉，并在该部分加上帽子。这个具体是什么，我不知道。第二部分是外显子部分，外显子部分编码氨基酸。所以，你可以逐个分析。第三部分，是内含子部分。内含子会涉及到RNA干涉作用，尤其是mRNA水平上的干涉，与内含子关系无比紧密。 如果是剪接之后 我估计 我也不用废话了 只剩下cDNA了，还有什么可说的？ |
2楼2010-09-23 23:41:28
zcqcau
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4楼2010-09-25 00:43:15
zcqcau
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5楼2010-10-02 16:47:53
