24小时热门版块排行榜

返回列表

zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 9904.4
散金: 57
红花: 2
帖子: 1384
在线: 40.5小时
虫号: 864634
注册: 2009-10-07
专业: 植物化学保护

[交流] 【求助/交流】如何分析mRNA（包括3‘-和5’端非编码区）

rt，如能举例，可追金币，万分感谢

谢谢虫友帮助，祝大家双节快乐啊

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

将有能量帮助他人作为自己的人生追求！

1楼 2010-09-23 23:04:46

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

molecula

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 37 (小学生)
贵宾: 0.417
金币: 6397.2
散金: 1745
红花: 27
沙发: 34
帖子: 1709
在线: 602小时
虫号: 759184
注册: 2009-04-28
专业: 病原细菌与放线菌生物学

★ ★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+5):谢谢分享。 2010-09-24 06:09:20
zcqcau(金币+3):你说的内含子不是mRNA上的吧？ 2010-09-24 23:34:32

你说的分析是分析什么？
整个mRNA序列？这个真是一个挑战

首先你要使用PP5 DNASTAR oliga等或者更精密的软件分析正序列

然后找出5'帽子和3'尾巴当然加帽子和尾巴是在剪接后水平上的

如果之前的话  还包括的整个内含子序列

所以我觉得你要根据具体情况具体分析

如果是剪接之前  那么请分为三部分来分析第一部分是5'端，也就是启动子之前部分，启动子编码甲酰甲硫氨酸。之前还有一部分序列。在剪接过程中会被去掉，并在该部分加上帽子。这个具体是什么，我不知道。第二部分是外显子部分，外显子部分编码氨基酸。所以，你可以逐个分析。第三部分，是内含子部分。内含子会涉及到RNA干涉作用，尤其是mRNA水平上的干涉，与内含子关系无比紧密。

如果是剪接之后  我估计我也不用废话了只剩下cDNA了，还有什么可说的？

赞一下(1人)

回复此楼

2楼2010-09-23 23:41:28

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 9904.4
散金: 57
红花: 2
帖子: 1384
在线: 40.5小时
虫号: 864634
注册: 2009-10-07
专业: 植物化学保护

引用回帖:

Originally posted by molecula at 2010-09-23 23:41:28:
你说的分析是分析什么？
整个mRNA序列？这个真是一个挑战

首先你要使用PP5 DNASTAR oliga等或者更精密的软件分析正序列

然后找出5'帽子和3'尾巴当然加帽子和尾巴是在剪接后水平上的

如果之前的 ...

我想问的是譬如“：启动子分析啊，信号肽啊，二三级结构预测啊。。。等等等

赞一下

回复此楼

将有能量帮助他人作为自己的人生追求！

3楼2010-09-24 23:35:16

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖