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小海豚1987

新虫 (初入文坛)

[求助] 急求：分析外显子和内含子的软件??已有4人参与

急求：分析外显子和内含子的软件??  我做的是无脊椎动物，基因组信息还没有完全上传NCBI，在网上看到一些网站都不能用，选择物种的下拉菜单里都没有我们做的物种。不知道应该怎么分析啊？求各位大虾帮忙！
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1楼2014-04-26 15:02:38
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-03 12:16:46
可能直接用实验方法更简单，分别用cDNA和基因组的DNA 做模板进行PCR，之后送去测序，cDNA 不包含的序列不就是内含子，如果需要小一些的片段，可以结合类似物种的同源基因的大致位点对于目的基因片段所在的DNA进行有限水解，电泳或者层析分离出最邻近目的基因的DNA片段，然后根据对应的目的基因片段的mRNA的序列（可以从 蛋白质产物序列反推）与含有该序列的DNA片段的序列比较即可知道内含子与外显子序列。
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6楼2014-07-03 11:16:03
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-04-26 23:55:56
小海豚1987: 金币+2, ★有帮助 2014-04-30 22:30:44
可以用GeneScan ，http://genes.mit.edu/GENESCAN.html
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2楼2014-04-26 22:27:24
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sunflower019

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小海豚1987: 金币+2, ★有帮助 2014-04-30 22:34:36
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-15 21:53:48
http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php
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3楼2014-04-28 10:51:05
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oylb

禁言 (正式写手)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验！ 2014-07-15 21:53:53
本帖内容被屏蔽
4楼2014-04-28 11:51:27
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