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心悦有天

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请问DNA提取的结果这样的原因已有1人参与

求助各位,我使用16s rDNA鉴定一株细菌,现在刚进行了第一步,按照某试剂盒说明提取基因组DNA,紫外测得提取的DNA样品,A260/A280为2.22,A260为1.946,核酸浓度为97.3 ng/μL。有几个问题:
(1)不是一般A260/A280在1.7-1.9之间是DNA纯度比较高,请问我这个为什么还大于2?是RNA污染吗?
(2)这个结果可以直接用于接下来的PCR吗?
(3)下面照片是样品的峰形图,为什么不是呈现最高峰的那种?
另(4)接下来PCR的引物是通用引物27F和1492R,但看一些文献里这两个引物还有所差异?
没接触过分子生物学,希望做过的筒子多度指导,谢了~~

请问DNA提取的结果这样的原因
DNA提取结果.jpg
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打败番茄炒蛋

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
心悦有天: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-05-07 16:39:13
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2015-05-07 22:08:07
A260/A280和A260/A230是核酸纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7-8.5 下其比值应该在2.0 或2.5,A260 / A280的比值, 用于评估样品的纯度, 因为蛋白的吸收峰是280 nm。 纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。
A230是多肽、芳香基团、苯酚和一些碳氢化合物的吸光度,A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、多肽、苯酚等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0 。A280是蛋白质的吸光度。

你的A260/A230 是0.29? 这样的话不建议你PCR
天生自弃难丽质
2楼2015-05-07 08:43:18
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心悦有天

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 打败番茄炒蛋 at 2015-05-07 08:43:18
A260/A280和A260/A230是核酸纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7-8.5 下其比值应该在2.0 或2.5,A260 / A280的比值, 用于评估样品的纯度, 因为蛋白的吸收峰是280 nm。 纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。 ...

还是谢谢你,我的帖子过去这么久了,实验也都完成了,最后我的A260/A280为2.22,PCR做了结果还可以
3楼2015-05-07 16:34:33
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红红三缺一

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 心悦有天 at 2015-05-07 16:34:33
还是谢谢你,我的帖子过去这么久了,实验也都完成了,最后我的A260/A280为2.22,PCR做了结果还可以...

你好,我也想用通用引物27F和1492R扩增菌DNA,请问您方便把序列发给我一下么?非常感谢q 862237138
4楼2015-05-07 20:44:57
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baichi121234

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

5楼2015-05-07 22:12:33
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心悦有天

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 红红三缺一 at 2015-05-07 20:44:57
你好,我也想用通用引物27F和1492R扩增菌DNA,请问您方便把序列发给我一下么?非常感谢q 862237138...

很久没上小木虫了,不知你是否还需要,这是我用的引物序列
27F:5'-AGAGT  TTGAT  CCTGG  CTCAG-3'
1492R: 5'-GGTTA  CCTTG  TTACG  ACTT-3'
6楼2015-06-09 16:13:42
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