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willy0805

铜虫 (初入文坛)

[求助] DNA提取测序,DNA提取后,电泳条带弥散拖尾

提取基因组DNA用于PCR扩增后测序鉴定。DNA提取后电泳发现拖带和弥散严重,请高手分析下原因和解决方法

右1为marker,右2和4为样品,3和5为稀释样
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guangmingzhizi

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果材料不是很特别的话,不是材料问题的话,重新按要求配制新的提取液吧。
我的blog:http://vipbio.bokee.com
2楼2012-02-15 16:01:59
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whb21

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+3): 鼓励发帖交流! 2012-02-15 20:24:36
提取基因组DNA出现拖尾现象很正常,不知道你用的是试剂盒提取还是其他方法。从图上看点样孔下面貌似有一个条带,应该是基因组DNA,可以做PCR试试看看目标条带能不能P出来 祝好运
3楼2012-02-15 16:13:19
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7788945

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该是里边残余的RNA条带吧。另外点样孔里有条带,建议抽提的时候少抽点
4楼2012-02-15 19:04:38
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thaw

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可能是降解了我提过做SOUTHERN的,没问题
5楼2012-02-15 20:32:54
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willy0805

铜虫 (初入文坛)

用的是试剂盒提的,真菌材料,接下来该做PCR了,不知道这样可以做么,还是要重新提下DNA?处理样品时没用液氮研磨,普通研磨的,不知道有没有影响?
6楼2012-02-16 09:19:38
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longrna

新虫 (正式写手)

正常来说,这样的基因组DNA提取结果我觉得不可以。
1、点样孔有很明显的残留。可能是蛋白或其他杂质没去除干净。
2、不但弥散太严重,还没有>=23kb的主带。

建议多注意点操作重提吧。强大的材料可以不液氮研磨,真菌还是液氮一下吧。
其实真菌不好做...
伟大航线....
7楼2012-02-16 12:56:31
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朝着江河走

金虫 (小有名气)

PCR结束后可以加一点RNA酶,把RNA降解掉,不管有没有RNA都加上,这样就可以排除RNA的影响了
生命在于运动
8楼2013-04-09 23:26:34
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