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原孟子

金虫 (小有名气)

[求助] 16SrDNA鉴定需不需要PCR纯化 已有2人参与

如题所示,想知道操作过程中到底需不需要做PCR纯化这一步,我看小虫子们有的直接PCR扩增然后直接去测序的,也有扩增纯化再测序的,我做的主要是从溢油海岸带中分离纯化鉴定纯菌。。。所以不知道是不是需要做纯化这一步,纠结ing,请如实告诉我,谢谢啦
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clark2010

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2015-03-24 09:18:56
是什么菌无所谓。我从来都是纯化之后送公司的。即使你不纯化,去了公司,也会先给你纯化一下才上机测序的。
2楼2015-03-24 00:07:32
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Little栋栋

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-03-24 09:19:03
原孟子: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-03-24 18:56:14
朋友你好,我是做乳杆菌的,16srDNA序列分析 要先提取DNA然后PCR,扩增后纯化一下 送去测序
严格来讲还是应该克隆后再测序,选用克隆载体上的引物可以完整准确的测出16SR序列
3楼2015-03-24 00:24:10
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原孟子

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Little栋栋 at 2015-03-24 00:24:10
朋友你好,我是做乳杆菌的,16srDNA序列分析 要先提取DNA然后PCR,扩增后纯化一下 送去测序
严格来讲还是应该克隆后再测序,选用克隆载体上的引物可以完整准确的测出16SR序列

好的,谢谢啦
认真吃饭,认真睡觉,认真生活。
4楼2015-03-24 18:55:51
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原孟子

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by clark2010 at 2015-03-24 00:07:32
是什么菌无所谓。我从来都是纯化之后送公司的。即使你不纯化,去了公司,也会先给你纯化一下才上机测序的。

好的,谢啦
认真吃饭,认真睡觉,认真生活。
5楼2015-03-24 18:56:04
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Longnil

新虫 (小有名气)

是不需要纯化的,我们的扩出16s后直接送到公司测序的
lifeisbeautiful
6楼2015-03-28 08:58:34
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zergbloody

铁虫 (正式写手)

需要纯化的 不过公司会代做

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-03-28 10:08:27
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8楼2015-03-29 10:06:39
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冰尘子

铁虫 (初入文坛)

一般公司会做一次纯化,这要看你的样品如何,我们一般送公司前要检测自己样品纯度(260/280)和浓度(公司测序有要求)是否达标。环境样品含有杂质(腐殖酸)较多。
走好人生路
9楼2015-04-08 13:49:43
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