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求助关于土壤细菌分离鉴定的知识,希望朋友帮忙解答
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| 我要从土壤中分离和鉴定出未知的菌(细菌或真菌均存在),求助怎样设计实验方案,怎样的一个实验思路也行。 |
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2楼2012-04-17 20:43:46
WSW_Alone
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【答案】应助回帖
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renlu0521: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢! 2012-04-17 22:11:50
renlu0521: 金币+4, ★★★★★最佳答案 2012-04-18 22:35:35
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renlu0521: 金币+4, ★★★★★最佳答案 2012-04-18 22:35:35
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1.你是否是从土壤中筛选新菌种?如果是筛选新菌种的话,那这个还是有一定难度的,要用特殊的培养基进行针对性的筛选,比如筛哪类菌找对应的培养基,当然有的培养基是秘方了,如果你实验室有做过的就直接用现成的方法即可。 2.如果你是做土壤可培养微生物分析的话,那么你考虑你的样点是否有特殊性,比如低温,高温,高盐等情况,也是针对性的选用几种培养基进行筛选。如果是普通的土壤,那么用几种常用的培养基比如牛肉膏蛋白胨for细菌,高氏一号for放线菌,孟加拉红培养基for真菌等进行筛选。 3.针对你后来提的问题,培养基上至少有两种菌,你最好还是划线分离纯化一下,镜检是否是单菌再进行PCR鉴定,当然一般划线分离1-2次挑取单菌落也可以。分离纯化的方法就是划线分离了(这个百度一下就知道了),鉴定就看你是什么菌了,细菌的话用16S通用引物(27f,1492r),真菌的话用18S通用引物(ITS1,ITS4)扩增后送测。 不知道我是否说清楚了,相互交流 |

3楼2012-04-17 20:54:32
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您好~非常感谢帮忙,但是还是有几个不大明白的地方(根据您提出的三个方面) 1.目前是有两种土壤样品。不知道其中可能含有那种菌种,但目前可以确定的是一定有病原菌。由于我们实验室不是研究这方面的,现在有点茫然。目前也只用了PDA培养基和牛肉膏蛋白胨培养基进行初步筛选。。。也不知道对不对 主要的目的就是讲土壤样品中主要的病原菌进行分离,并鉴定出所属种属。 2.如上所说,土壤是病害土壤,目前只用了以上两种培养基(另外PDA培养基中加入了硫酸链霉素抑制细菌和放线菌生长,我也知道并不能抑制所有细菌。。但是目前师兄给的实验思路是这样的就照做了) 3.目前还只进行了第一次的划线培养。。。主要是考虑多种菌的问题。。所以不大明白需要划线培养到怎样的程度进行PCR检测 以上,非常感谢您的帮忙~~结束后会补上金币,谢谢您~~ ![]() |
4楼2012-04-17 22:11:01
WSW_Alone
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5楼2012-04-18 09:59:24
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非常感谢您的帮助~~今天又详细的问了老师,需要找出主要的病原菌~~也已经了解怎样做了,非常感谢!