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mashuyan13

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么做菌种鉴定 已有6人参与

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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

郁闷~大家说的都很乱
第一步:提总DNA,扩16S,NCBI blast,相似度比较低的话可以考虑是潜在新种,然后需要根据16S 全长调取相关序列,构建分子系统进化树,确定要一起做实验的标准菌株,等菌株到了,才能开始下一步
第二步:提标准菌株总DNA,可以先做杂交(必须要做的一个环节),如果数据不错,再继续做后续的生理生化实验比较保险,要不你做一个相似度高于99%,杂交一出来高于70%,做了等于白做
第三步才是各种生理生化实验,你啥都不懂。。。做这个干啥
8楼2014-04-12 16:33:22
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趁年轻到远方

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先形态观察,再生理生化实验,确定大方向,最后分子鉴定,dna测序。
2楼2014-04-12 10:30:24
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吹着泡泡的夏

金虫 (小有名气)


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可以形态学,生理生化实验,还可以通过分子手段鉴定
走着走着就长大了
3楼2014-04-12 10:47:46
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mashuge

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
形态学,分子,生理生化
珍惜自己现在拥有的,别等失去才追悔莫及,人只有经历了才会懂才会成熟,加油,未来的日子好好过!
4楼2014-04-12 10:54:10
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美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)

技术服务-实验代做


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好几个层面可以鉴定,比较准确的是扩增,测序,比对

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-04-12 15:23:07
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普通回帖

lbz1219

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
初步确定一般是形态学观察。但是如果你要确切的结果,最好去专业鉴定机构,这样有说服力。
5楼2014-04-12 14:01:32
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euaomte

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先看形态,然后是理化试验,药敏试验,最后基因鉴定。
既然选择了自己的路,即使跪着也要走完.
7楼2014-04-12 15:44:34
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永峰1230

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by dllchina at 2014-04-12 16:33:22
郁闷~大家说的都很乱
第一步:提总DNA,扩16S,NCBI blast,相似度比较低的话可以考虑是潜在新种,然后需要根据16S 全长调取相关序列,构建分子系统进化树,确定要一起做实验的标准菌株,等菌株到了,才能开始下一 ...

很厉害,,
12
9楼2014-04-12 18:49:16
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国产粗人

金虫 (初入文坛)

观察微观和宏观形态,对比一下菌种鉴定手册,实在不行就dna测序

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2014-04-12 18:58:20
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