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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 怎么做菌种鉴定
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 国产粗人 at 2014-04-12 18:58:20
观察微观和宏观形态，对比一下菌种鉴定手册，实在不行就dna测序

看过菌种鉴定手册觉得没大用，我的是混合菌，一直分离不出单菌落，卡这了，嘿嘿你做过厌氧菌吗
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11楼2014-04-14 13:27:47
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 趁年轻到远方 at 2014-04-12 10:30:24
先形态观察，再生理生化实验，确定大方向，最后分子鉴定，dna测序。

好的，谢谢，但是我的是混合菌种，一直分离不出单菌落
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12楼2014-04-14 13:32:59
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by dllchina at 2014-04-12 16:33:22
郁闷~大家说的都很乱
第一步：提总DNA，扩16S，NCBI blast，相似度比较低的话可以考虑是潜在新种，然后需要根据16S 全长调取相关序列，构建分子系统进化树，确定要一起做实验的标准菌株，等菌株到了，才能开始下一 ...

科研需要，懂答题步骤了，就是做不出单菌落
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13楼2014-04-14 13:35:03
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lbz1219 at 2014-04-12 14:01:32
初步确定一般是形态学观察。但是如果你要确切的结果，最好去专业鉴定机构，这样有说服力。

菌种鉴定不是自己就可以做吗，专业机构给不给分离混合菌呀嘿嘿
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14楼2014-04-14 13:51:57
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 趁年轻到远方 at 2014-04-12 10:30:24
先形态观察，再生理生化实验，确定大方向，最后分子鉴定，dna测序。

16SrRNA鉴定，扩增出的产物是不是DNA呀，嘿嘿测序的话需要通测吗
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15楼2014-04-14 13:55:17
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见神一笑

木虫 (著名写手)
楼主还是看文献吧，虽然菌种鉴定的内容差不多都是那些，但不同的菌还是有些差异的。你自己做哪类菌就上ＩＪＳＥＭ上看和的文献。
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好好努力
16楼2014-04-14 14:37:20
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趁年轻到远方

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by mashuyan13 at 2014-04-14 13:32:59
好的，谢谢，但是我的是混合菌种，一直分离不出单菌落...

稀释涂布，多做几次。慢慢就纯化了。
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17楼2014-04-14 16:20:41
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趁年轻到远方

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
15楼: Originally posted by mashuyan13 at 2014-04-14 13:55:17
16SrRNA鉴定，扩增出的产物是不是DNA呀，嘿嘿测序的话需要通测吗...

是dna，测序只是测这一个序列的。电泳有明确条带时，再用mark，把你需要的给挖出来，再PCR一下，交由专门的公司测序。
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18楼2014-04-14 16:28:01
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doris.gao

新虫 (初入文坛)
菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA，然后PCR扩增16s rDNA片段，上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌（当然也有例外，DNA序列仅仅是一个参考指标）
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19楼2014-04-15 16:47:21
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lbz1219

金虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by mashuyan13 at 2014-04-14 13:51:57
菌种鉴定不是自己就可以做吗，专业机构给不给分离混合菌呀嘿嘿...

当然可以自己做。摸索，引物，测序不是短时间可以做完的。混合菌的话，你自己做稀释-涂布-划线，一般就可以分离菌种了（我没有问过）。但是如果你要发论文的话，建议去专业机构。
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20楼2014-04-15 21:07:48
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