应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 弱弱的问一个PCR的问题，关于鉴定菌种的
71/1返回列表
查看: 2125  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

na466433306

金虫 (小有名气)

[交流] 弱弱的问一个PCR的问题，关于鉴定菌种的

最近想要检测某样品中几个菌种的存在性，我知道要设计特异性引物进行PCR，但这个引物是怎么设计呢？
是说找到这个菌种的特征性基因吗？
还是说在NCBI中找出这个菌种的几个已报道的基因序列，找到保守区什么的呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2014-01-06 09:49:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lf6220

至尊木虫 (著名写手)
★
na466433306(金币+1): 谢谢参与
直接27f和1492r

[ 发自小木虫客户端 ]
回复此楼
2楼2014-01-06 09:54:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

na466433306

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lf6220 at 2014-01-06 09:54:37
直接27f和1492r

不是这个意思呢，这个引物的目的是p出特定菌种的序列，如果有条带就代表这个样品中有这个菌种，没有条带就代表没有这个菌种
赞一下 回复此楼
3楼2014-01-06 10:20:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lf6220

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by na466433306 at 2014-01-06 10:20:39
不是这个意思呢，这个引物的目的是p出特定菌种的序列，如果有条带就代表这个样品中有这个菌种，没有条带就代表没有这个菌种...

16S RNA的V3或V6,随便设计扩増200-300bp的引物就可以了，pcr-dgge不就这样吗，下文献看看

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-06 12:58:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang1xin

新虫 (小有名气)
★
na466433306(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by lf6220 at 2014-01-06 12:58:12
16S RNA的V3或V6,随便设计扩増200-300bp的引物就可以了，pcr-dgge不就这样吗，下文献看看
...

楼上说的是找到这个菌的16s RNA 的V3或V6区吗？
我当时对我想要的菌进行了16s rDNA测序，能不能根据这个测序结果找到它的V3或V6区？
赞一下 回复此楼
6楼2014-08-05 20:32:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bohelv

铜虫 (初入文坛)
★
na466433306(金币+1): 谢谢参与
我最近也在做相关工作，同问~
赞一下 回复此楼
7楼2016-01-06 21:12:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
yingying15885楼
2014-01-06 22:22   回复  
na466433306(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 na466433306 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭