【答案】应助回帖

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1楼2012-01-04 13:43:01

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Sunflower89

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【答案】应助回帖

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zhang8826857(金币+5, MicEPI+1): 鼓励新虫，good 2012-01-04 22:24:21

引用回帖:

4楼: Originally posted by wjf008 at 2012-01-04 17:25:18:
通过16sRNA的pcr进行基因测序，构建系统发育树，楼主是要这样么？

对，如果你要是想知道你分离的菌株是属于哪个属，哪个种的话，16s rRNA基因序列比对构建进化树就可以知道了；如果你的目的是鉴定新种的话，做完上面这些步骤，初步鉴定之后，还要进行多相分类学鉴定。
多相分类学鉴定包括表型特征分析（生理生化特征，酶学特征，脂肪酸组分分析等），遗传性分析（16S rRNA基因序列同源比对，基因组DNA的分子杂交，G+C含量）和系统发育分析三个方面。

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6楼2012-01-04 17:57:36

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其实简单点，看看杂志上人家做什么指标，你就做什么指标了。

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快乐生活，我快乐

8楼2012-01-05 08:45:14

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Sunflower89

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zhang8826857(金币+5): 鼓励新虫，加油 2012-01-04 16:58:09
qiaolinkun(金币+10): ★★★★★最佳答案谢了！ 2012-01-04 20:55:34

我以细菌为例简单的说一下：
提取总DNA，对16s rRNA基因序列进行扩增（做pcr），对这个序列进行测序（你可以让测序公司给你测），在EZTEXON上进行比，就可以初步鉴定这株细菌的分类地位了。

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2楼2012-01-04 16:22:37

qiaolinkun

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楼: Originally posted by Sunflower89 at 2012-01-04 16:22:37:
我以细菌为例简单的说一下：
提取总DNA，对16s rRNA基因序列进行扩增（做pcr），对这个序列进行测序（你可以让测序公司给你测），在EZTEXON上进行比，就可以初步鉴定这株细菌的分类地位了。

只需要做16s rRNA么？

3楼2012-01-04 17:01:37

wjf008

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通过16sRNA的pcr进行基因测序，构建系统发育树，楼主是要这样么？

4楼2012-01-04 17:25:18

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楼: Originally posted by wjf008 at 2012-01-04 17:25:18:
通过16sRNA的pcr进行基因测序，构建系统发育树，楼主是要这样么？

我想知道除了对16s rRNA进行测序是否还需要其它手段进行鉴定？

5楼2012-01-04 17:55:39

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6楼: Originally posted by Sunflower89 at 2012-01-04 17:57:36:
对，如果你要是想知道你分离的菌株是属于哪个属，哪个种的话，16s rRNA基因序列比对构建进化树就可以知道了；如果你的目的是鉴定新种的话，做完上面这些步骤，初步鉴定之后，还要进行多相分类学鉴定。
多相分类 ...

请问您口中的“酶学特征”是什么意思，能否举例说明？

流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜素论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。

7楼2012-01-05 00:40:44

hnlbdu

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回答的很好。

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9楼2013-01-11 16:36:38

Sunflower89

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7楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2012-01-05 00:40:44
请问您口中的“酶学特征”是什么意思，能否举例说明？...

酶学特征就是你的细菌有哪些酶活性，比如氧化酶、过氧化氢酶、脲酶、色氨酸脱氢酶、鸟氨酸脱氢酶、β-半乳糖苷酶.......等等，具体要做哪些酶是要看你的细菌属于哪个属之后，看它模式菌株都用了哪些指标就可以。

10楼2013-01-27 13:27:24